79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4006 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4006  protein of unknown function DUF664  100 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2899  hypothetical protein  50.27 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.792533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1618  hypothetical protein  50 
 
 		 195 aa  168  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0256  protein of unknown function DUF664  50.26 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8367  protein of unknown function DUF664  47.85 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3852  hypothetical protein  47.25 
 
 		 224 aa  147  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2107  hypothetical protein  46.24 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3296  protein of unknown function DUF664  46.55 
 
 		 223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461354  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0585  protein of unknown function DUF664  49.18 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.106985 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22750  Protein of unknown function (DUF664)  45.5 
 
 		 196 aa  138  4.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2101  hypothetical protein  41.36 
 
 		 201 aa  133  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0659  protein of unknown function DUF664  43.46 
 
 		 192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.689351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0822  hypothetical protein  42.14 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4677  hypothetical protein  44.03 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.371903  hitchhiker  0.009196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2084  protein of unknown function DUF664  37.11 
 
 		 168 aa  94  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.623547  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1218  protein of unknown function DUF664  35.85 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299691  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2662  hypothetical protein  31.41 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0065374  normal  0.130482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3194  protein of unknown function DUF664  35.54 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.101119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3566  hypothetical protein  33.75 
 
 		 167 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.527928 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0233  protein of unknown function DUF664  34.39 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8812  protein of unknown function DUF664  30.86 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00338165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1650  protein of unknown function DUF664  35.4 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939726  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2316  hypothetical protein  31.48 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.299427  normal  0.014207 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2210  protein of unknown function DUF664  32.52 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5699  hypothetical protein  32.48 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1029  protein of unknown function DUF664  29.68 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0756  hypothetical protein  29.76 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1490  protein of unknown function DUF664  31.65 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0741  protein of unknown function DUF664  31.41 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7313  hypothetical protein  29.94 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1689  protein of unknown function DUF664  30.77 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5084  hypothetical protein  31.25 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1183  hypothetical protein  28.57 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0476476  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  32.3 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2347  hypothetical protein  67.5 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3380  hypothetical protein  31.48 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.499473 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0776  protein of unknown function DUF664  30.38 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3868  protein of unknown function DUF664  28.99 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1764  hypothetical protein  28.48 
 
 		 145 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.273474 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1314  hypothetical protein  31.79 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2794  protein of unknown function DUF664  32 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127816  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0936  hypothetical protein  29.49 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1293  hypothetical protein  30 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0332  protein of unknown function DUF664  31.48 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02080  Protein of unknown function (DUF664)  28.48 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3455  protein of unknown function DUF664  27.65 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00229137  hitchhiker  0.00402498 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27250  Protein of unknown function (DUF664)  28.12 
 
 		 169 aa  52.4  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119129  normal  0.205212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3866  protein of unknown function DUF664  30.13 
 
 		 166 aa  52  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542757  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5108  hypothetical protein  27.5 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408791  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4136  protein of unknown function DUF664  31.68 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7026  protein of unknown function DUF664  29.56 
 
 		 155 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.99462  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3244  hypothetical protein  28.82 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.062152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3489  protein of unknown function DUF664  30 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.920969 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2348  hypothetical protein  37.65 
 
 		 93 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1245  hypothetical protein  25.77 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3935  hypothetical protein  32.52 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  hitchhiker  0.00874096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1048  hypothetical protein  22.99 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2959  hypothetical protein  30.41 
 
 		 170 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5245  hypothetical protein  29.55 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5900  hypothetical protein  28.03 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.575694 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0637  protein of unknown function DUF664  27.95 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5165  protein of unknown function DUF664  25.77 
 
 		 175 aa  48.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0339  protein of unknown function DUF664  26.9 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6378  hypothetical protein  30.13 
 
 		 162 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19820  Protein of unknown function (DUF664)  26.34 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.867653  hitchhiker  0.00266163 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27380  Protein of unknown function (DUF664)  27.27 
 
 		 171 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0958  hypothetical protein  26.67 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0247  protein of unknown function DUF664  29.73 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0976  hypothetical protein  26.67 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0645805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1061  protein of unknown function DUF664  33.94 
 
 		 169 aa  45.1  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.957525  normal  0.854466 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5436  hypothetical protein  26.62 
 
 		 176 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20480  Protein of unknown function (DUF664)  28.83 
 
 		 188 aa  45.1  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.247017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6807  hypothetical protein  25.29 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.378283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2169  protein of unknown function DUF664  29.81 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  hitchhiker  0.00138887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2390  hypothetical protein  26.63 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265375  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21220  Protein of unknown function (DUF664)  28.4 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.087402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07380  Protein of unknown function (DUF664)  24.32 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0979  hypothetical protein  26.06 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5225  hypothetical protein  28.31 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>