17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2347 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2347  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  168  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4677  hypothetical protein  96.08 
 
 
163 aa  103  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.371903  hitchhiker  0.009196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0822  hypothetical protein  78.43 
 
 
166 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1218  protein of unknown function DUF664  63.83 
 
 
172 aa  60.1  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299691  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4006  protein of unknown function DUF664  67.5 
 
 
189 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0585  protein of unknown function DUF664  59.52 
 
 
202 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.106985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8367  protein of unknown function DUF664  57.5 
 
 
198 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22750  Protein of unknown function (DUF664)  57.14 
 
 
196 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1650  protein of unknown function DUF664  50 
 
 
179 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939726  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0659  protein of unknown function DUF664  62.5 
 
 
192 aa  47.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.689351  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3852  hypothetical protein  57.14 
 
 
224 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2899  hypothetical protein  53.49 
 
 
195 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.792533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0256  protein of unknown function DUF664  60 
 
 
204 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3296  protein of unknown function DUF664  55 
 
 
223 aa  43.9  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461354  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1618  hypothetical protein  52.38 
 
 
195 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2107  hypothetical protein  48.84 
 
 
204 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2101  hypothetical protein  55 
 
 
201 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>