74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3935 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3935  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  364  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  hitchhiker  0.00874096 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0741  protein of unknown function DUF664  65.19 
 
 
196 aa  222  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3489  protein of unknown function DUF664  58.66 
 
 
192 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.920969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5900  hypothetical protein  48.37 
 
 
189 aa  155  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.575694 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4136  protein of unknown function DUF664  48.07 
 
 
189 aa  150  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21220  Protein of unknown function (DUF664)  51.76 
 
 
179 aa  147  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.087402 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1650  protein of unknown function DUF664  44.38 
 
 
179 aa  122  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939726  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0332  protein of unknown function DUF664  45.88 
 
 
177 aa  121  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3455  protein of unknown function DUF664  46.78 
 
 
179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00229137  hitchhiker  0.00402498 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0233  protein of unknown function DUF664  46.06 
 
 
181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20480  Protein of unknown function (DUF664)  42.39 
 
 
188 aa  100  9e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.247017  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2169  protein of unknown function DUF664  38.32 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  hitchhiker  0.00138887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7313  hypothetical protein  35.23 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3566  hypothetical protein  36.52 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.527928 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0339  protein of unknown function DUF664  36.78 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2959  hypothetical protein  37.21 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.299373 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4677  hypothetical protein  36.42 
 
 
163 aa  73.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.371903  hitchhiker  0.009196 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02080  Protein of unknown function (DUF664)  35.15 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8812  protein of unknown function DUF664  32.93 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00338165  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0822  hypothetical protein  32.73 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2210  protein of unknown function DUF664  34.86 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1314  hypothetical protein  32.93 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2390  hypothetical protein  33.94 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265375  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1061  protein of unknown function DUF664  35.71 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.957525  normal  0.854466 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0776  protein of unknown function DUF664  35.06 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3244  hypothetical protein  33.14 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.062152  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0659  protein of unknown function DUF664  34.94 
 
 
192 aa  62.4  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.689351  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0256  protein of unknown function DUF664  36.09 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0477  protein of unknown function DUF664  36.97 
 
 
186 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1218  protein of unknown function DUF664  32.96 
 
 
172 aa  59.7  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299691  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3380  hypothetical protein  40.48 
 
 
144 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.499473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1689  protein of unknown function DUF664  34.32 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1196  hypothetical protein  37.43 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.974573  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2316  hypothetical protein  37.8 
 
 
175 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.299427  normal  0.014207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2107  hypothetical protein  33.14 
 
 
204 aa  59.3  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1764  hypothetical protein  32.9 
 
 
145 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.273474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2084  protein of unknown function DUF664  30.9 
 
 
168 aa  58.2  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.623547  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1183  hypothetical protein  34.88 
 
 
175 aa  58.2  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0476476  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27250  Protein of unknown function (DUF664)  31.35 
 
 
169 aa  57.8  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119129  normal  0.205212 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3852  hypothetical protein  31.68 
 
 
224 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1132  putative mini-circle protein  35.07 
 
 
126 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27380  Protein of unknown function (DUF664)  32.4 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2101  hypothetical protein  32.67 
 
 
201 aa  54.7  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6807  hypothetical protein  31.25 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.378283 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5165  protein of unknown function DUF664  33.86 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1490  protein of unknown function DUF664  36.14 
 
 
175 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1293  hypothetical protein  33.72 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315219  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0756  hypothetical protein  32.93 
 
 
172 aa  52.4  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19820  Protein of unknown function (DUF664)  30.81 
 
 
185 aa  52.8  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.867653  hitchhiker  0.00266163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5225  hypothetical protein  30.86 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2794  protein of unknown function DUF664  30.43 
 
 
164 aa  52.4  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127816  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4006  protein of unknown function DUF664  31.9 
 
 
189 aa  51.2  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1029  protein of unknown function DUF664  31.82 
 
 
165 aa  51.2  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3296  protein of unknown function DUF664  29.76 
 
 
223 aa  50.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461354  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22750  Protein of unknown function (DUF664)  30.73 
 
 
196 aa  49.7  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0585  protein of unknown function DUF664  28.82 
 
 
202 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.106985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2662  hypothetical protein  28.48 
 
 
170 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0065374  normal  0.130482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07380  Protein of unknown function (DUF664)  27.88 
 
 
186 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7026  protein of unknown function DUF664  33.54 
 
 
155 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.99462  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5245  hypothetical protein  31.47 
 
 
191 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1048  hypothetical protein  28.93 
 
 
187 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1618  hypothetical protein  26.54 
 
 
195 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2899  hypothetical protein  25.93 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.792533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2997  protein of unknown function DUF664  38.04 
 
 
155 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8367  protein of unknown function DUF664  27.33 
 
 
198 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5401  protein of unknown function DUF664  31.1 
 
 
189 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3198  protein of unknown function DUF664  32.18 
 
 
179 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3868  protein of unknown function DUF664  30.43 
 
 
172 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5084  hypothetical protein  28.48 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5699  hypothetical protein  30.77 
 
 
165 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0637  protein of unknown function DUF664  29.13 
 
 
195 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2348  hypothetical protein  39.71 
 
 
93 aa  42  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4040  protein of unknown function DUF664  27.71 
 
 
177 aa  42  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5542  protein of unknown function DUF664  32.3 
 
 
171 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>