91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0776 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0776  protein of unknown function DUF664  100 
 
 
173 aa  345  1e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8812  protein of unknown function DUF664  50.32 
 
 
190 aa  138  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00338165  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2959  hypothetical protein  46.99 
 
 
170 aa  130  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.299373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3566  hypothetical protein  47.56 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.527928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7313  hypothetical protein  44.51 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1490  protein of unknown function DUF664  48.7 
 
 
175 aa  127  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3244  hypothetical protein  47.9 
 
 
170 aa  125  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.062152  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1293  hypothetical protein  47.34 
 
 
175 aa  121  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315219  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2390  hypothetical protein  43.95 
 
 
170 aa  120  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265375  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1183  hypothetical protein  48.52 
 
 
175 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0476476  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02080  Protein of unknown function (DUF664)  40.61 
 
 
180 aa  114  7.999999999999999e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3198  protein of unknown function DUF664  43.2 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27380  Protein of unknown function (DUF664)  41.57 
 
 
171 aa  107  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2210  protein of unknown function DUF664  41.18 
 
 
173 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21220  Protein of unknown function (DUF664)  42.77 
 
 
179 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.087402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1314  hypothetical protein  43.02 
 
 
191 aa  102  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0332  protein of unknown function DUF664  39.78 
 
 
177 aa  100  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1061  protein of unknown function DUF664  37.89 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.957525  normal  0.854466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27250  Protein of unknown function (DUF664)  36.2 
 
 
169 aa  97.8  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119129  normal  0.205212 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0339  protein of unknown function DUF664  39.24 
 
 
190 aa  97.4  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3880  hypothetical protein  37.84 
 
 
153 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00585365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3455  protein of unknown function DUF664  43.43 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00229137  hitchhiker  0.00402498 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2169  protein of unknown function DUF664  40.23 
 
 
187 aa  95.1  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  hitchhiker  0.00138887 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20480  Protein of unknown function (DUF664)  39.34 
 
 
188 aa  94  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.247017  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0233  protein of unknown function DUF664  39.66 
 
 
181 aa  92  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1650  protein of unknown function DUF664  37.08 
 
 
179 aa  91.7  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939726  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0756  hypothetical protein  37.82 
 
 
172 aa  91.7  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6807  hypothetical protein  36.09 
 
 
170 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.378283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0822  hypothetical protein  38.36 
 
 
166 aa  88.2  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0477  protein of unknown function DUF664  39.64 
 
 
186 aa  87  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2084  protein of unknown function DUF664  35.67 
 
 
168 aa  86.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.623547  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1029  protein of unknown function DUF664  37.84 
 
 
165 aa  85.1  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0432  hypothetical protein  35.22 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5084  hypothetical protein  38.51 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2662  hypothetical protein  35.9 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0065374  normal  0.130482 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2316  hypothetical protein  37.04 
 
 
175 aa  79  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.299427  normal  0.014207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1196  hypothetical protein  43.12 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.974573  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1218  protein of unknown function DUF664  36.88 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299691  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5436  hypothetical protein  35.48 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315547  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5542  protein of unknown function DUF664  34.5 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3380  hypothetical protein  37.42 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.499473 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0936  hypothetical protein  33.14 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4677  hypothetical protein  38.99 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.371903  hitchhiker  0.009196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5699  hypothetical protein  35.54 
 
 
165 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6378  hypothetical protein  34.9 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5900  hypothetical protein  36.05 
 
 
189 aa  72  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.575694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  37.42 
 
 
396 aa  71.6  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1764  hypothetical protein  34.01 
 
 
145 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.273474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4136  protein of unknown function DUF664  36.84 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1048  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2997  protein of unknown function DUF664  38.75 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0741  protein of unknown function DUF664  34.29 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3489  protein of unknown function DUF664  37.06 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.920969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3868  protein of unknown function DUF664  37.42 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7026  protein of unknown function DUF664  30.57 
 
 
155 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.99462  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0256  protein of unknown function DUF664  34.57 
 
 
204 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07380  Protein of unknown function (DUF664)  32.12 
 
 
186 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1689  protein of unknown function DUF664  35 
 
 
183 aa  62.4  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4040  protein of unknown function DUF664  34.71 
 
 
177 aa  62.4  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5245  hypothetical protein  31.15 
 
 
191 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5108  hypothetical protein  30.49 
 
 
199 aa  62  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408791  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0637  protein of unknown function DUF664  34.34 
 
 
195 aa  61.6  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3866  protein of unknown function DUF664  34.62 
 
 
166 aa  61.6  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542757  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3852  hypothetical protein  31.68 
 
 
224 aa  61.2  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2107  hypothetical protein  32.32 
 
 
204 aa  60.8  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1751  protein of unknown function DUF664  33.12 
 
 
163 aa  60.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3296  protein of unknown function DUF664  32.16 
 
 
223 aa  58.5  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3935  hypothetical protein  31.75 
 
 
183 aa  58.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  hitchhiker  0.00874096 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5401  protein of unknown function DUF664  34.34 
 
 
189 aa  57.4  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0585  protein of unknown function DUF664  34.38 
 
 
202 aa  57.4  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.106985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1245  hypothetical protein  28.82 
 
 
197 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209232 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1132  putative mini-circle protein  37.04 
 
 
126 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22750  Protein of unknown function (DUF664)  30.59 
 
 
196 aa  55.1  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2794  protein of unknown function DUF664  33.33 
 
 
164 aa  54.3  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127816  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5165  protein of unknown function DUF664  31.21 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0342  protein of unknown function DUF664  31.1 
 
 
202 aa  52.4  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0973615  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19820  Protein of unknown function (DUF664)  29.83 
 
 
185 aa  52  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.867653  hitchhiker  0.00266163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5225  hypothetical protein  32.4 
 
 
204 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4006  protein of unknown function DUF664  31.65 
 
 
189 aa  50.8  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8367  protein of unknown function DUF664  30 
 
 
198 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0976  hypothetical protein  27.54 
 
 
200 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0645805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0958  hypothetical protein  27.54 
 
 
200 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0247  protein of unknown function DUF664  30.06 
 
 
211 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0979  hypothetical protein  27.71 
 
 
200 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0659  protein of unknown function DUF664  27.52 
 
 
192 aa  45.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.689351  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2899  hypothetical protein  25 
 
 
195 aa  44.7  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.792533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2348  hypothetical protein  60.61 
 
 
93 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2121  hypothetical protein  28.28 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2101  hypothetical protein  25 
 
 
201 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1618  hypothetical protein  23.84 
 
 
195 aa  43.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3194  protein of unknown function DUF664  29.82 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.101119 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>