77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1751 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1751  protein of unknown function DUF664  100 
 
 
163 aa  332  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5436  hypothetical protein  73.08 
 
 
176 aa  230  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315547  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6378  hypothetical protein  64.67 
 
 
162 aa  189  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2662  hypothetical protein  48.34 
 
 
170 aa  128  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0065374  normal  0.130482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0756  hypothetical protein  42.57 
 
 
172 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1029  protein of unknown function DUF664  37.67 
 
 
165 aa  93.6  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3244  hypothetical protein  39.47 
 
 
170 aa  90.5  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.062152  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27250  Protein of unknown function (DUF664)  37.09 
 
 
169 aa  84  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119129  normal  0.205212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2959  hypothetical protein  36.02 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.299373 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2316  hypothetical protein  38.26 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.299427  normal  0.014207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7313  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3866  protein of unknown function DUF664  36.3 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542757  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0936  hypothetical protein  36.99 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27380  Protein of unknown function (DUF664)  36.31 
 
 
171 aa  82  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5699  hypothetical protein  34.67 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2084  protein of unknown function DUF664  35.26 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.623547  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0233  protein of unknown function DUF664  36.42 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3566  hypothetical protein  33.56 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.527928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0822  hypothetical protein  32.9 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1490  protein of unknown function DUF664  33.77 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4677  hypothetical protein  32.26 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.371903  hitchhiker  0.009196 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07380  Protein of unknown function (DUF664)  35.71 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2390  hypothetical protein  33.77 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265375  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5084  hypothetical protein  32 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1218  protein of unknown function DUF664  30.32 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299691  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3198  protein of unknown function DUF664  32.03 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1245  hypothetical protein  31.14 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6807  hypothetical protein  30.46 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.378283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1293  hypothetical protein  31.65 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315219  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8812  protein of unknown function DUF664  32.05 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00338165  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1183  hypothetical protein  31.82 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0476476  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1764  hypothetical protein  34.23 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.273474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0432  hypothetical protein  30.77 
 
 
171 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0332  protein of unknown function DUF664  33.33 
 
 
177 aa  61.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0776  protein of unknown function DUF664  33.12 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2794  protein of unknown function DUF664  30.99 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127816  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0637  protein of unknown function DUF664  29.19 
 
 
195 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3455  protein of unknown function DUF664  32.75 
 
 
179 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00229137  hitchhiker  0.00402498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5108  hypothetical protein  30.54 
 
 
199 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408791  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4040  protein of unknown function DUF664  29.19 
 
 
177 aa  58.2  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3380  hypothetical protein  30.14 
 
 
144 aa  57.8  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.499473 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21220  Protein of unknown function (DUF664)  31.74 
 
 
179 aa  57.8  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.087402 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5165  protein of unknown function DUF664  32.03 
 
 
175 aa  57.4  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5225  hypothetical protein  29.68 
 
 
204 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1048  hypothetical protein  31.65 
 
 
187 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1061  protein of unknown function DUF664  28.29 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.957525  normal  0.854466 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1314  hypothetical protein  31.58 
 
 
191 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7026  protein of unknown function DUF664  31.76 
 
 
155 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.99462  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2210  protein of unknown function DUF664  30.13 
 
 
173 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22750  Protein of unknown function (DUF664)  31.82 
 
 
196 aa  54.7  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1132  putative mini-circle protein  34.78 
 
 
126 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5900  hypothetical protein  30.51 
 
 
189 aa  54.3  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.575694 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1650  protein of unknown function DUF664  31.21 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939726  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20480  Protein of unknown function (DUF664)  31.46 
 
 
188 aa  52  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.247017  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3868  protein of unknown function DUF664  31.45 
 
 
172 aa  51.6  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0979  hypothetical protein  29.59 
 
 
200 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0339  protein of unknown function DUF664  31.17 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1689  protein of unknown function DUF664  32.23 
 
 
183 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2997  protein of unknown function DUF664  33.77 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5245  hypothetical protein  30.51 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02080  Protein of unknown function (DUF664)  28.48 
 
 
180 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5401  protein of unknown function DUF664  31.65 
 
 
189 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2169  protein of unknown function DUF664  29.27 
 
 
187 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  hitchhiker  0.00138887 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0976  hypothetical protein  28.99 
 
 
200 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0645805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0958  hypothetical protein  28.99 
 
 
200 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  31.79 
 
 
396 aa  48.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0247  protein of unknown function DUF664  28.98 
 
 
211 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3880  hypothetical protein  32.35 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00585365 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0585  protein of unknown function DUF664  26.99 
 
 
202 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.106985 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3489  protein of unknown function DUF664  26.54 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.920969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5542  protein of unknown function DUF664  29.37 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2348  hypothetical protein  37.5 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4136  protein of unknown function DUF664  28.57 
 
 
189 aa  44.7  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2107  hypothetical protein  26.51 
 
 
204 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3296  protein of unknown function DUF664  26.71 
 
 
223 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461354  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0741  protein of unknown function DUF664  29.56 
 
 
196 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8367  protein of unknown function DUF664  25.34 
 
 
198 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>