55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3880 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3880  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  315  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00585365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3244  hypothetical protein  40.14 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.062152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2959  hypothetical protein  40 
 
 		 170 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299373 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0776  protein of unknown function DUF664  37.84 
 
 		 173 aa  96.7  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3566  hypothetical protein  39.86 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.527928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7313  hypothetical protein  38.1 
 
 		 168 aa  90.5  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8812  protein of unknown function DUF664  38.1 
 
 		 190 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00338165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2390  hypothetical protein  36.18 
 
 		 170 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265375  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6807  hypothetical protein  36.31 
 
 		 170 aa  84.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.378283 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27380  Protein of unknown function (DUF664)  34.81 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1293  hypothetical protein  40.38 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02080  Protein of unknown function (DUF664)  34.42 
 
 		 180 aa  80.1  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1183  hypothetical protein  40.38 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0476476  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1490  protein of unknown function DUF664  36.17 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3198  protein of unknown function DUF664  36.42 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0756  hypothetical protein  33.56 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2662  hypothetical protein  35.29 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0065374  normal  0.130482 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0233  protein of unknown function DUF664  32.94 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2316  hypothetical protein  38.57 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.299427  normal  0.014207 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27250  Protein of unknown function (DUF664)  39.51 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119129  normal  0.205212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2210  protein of unknown function DUF664  32.68 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1314  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  60.5  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0339  protein of unknown function DUF664  30.38 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0332  protein of unknown function DUF664  33.94 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1061  protein of unknown function DUF664  30.34 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.957525  normal  0.854466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2169  protein of unknown function DUF664  32.5 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  hitchhiker  0.00138887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0432  hypothetical protein  31.69 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6378  hypothetical protein  32.12 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1650  protein of unknown function DUF664  28.57 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939726  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1029  protein of unknown function DUF664  30.77 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2084  protein of unknown function DUF664  29.33 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.623547  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0477  protein of unknown function DUF664  31.17 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3455  protein of unknown function DUF664  32.26 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00229137  hitchhiker  0.00402498 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21220  Protein of unknown function (DUF664)  29.24 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.087402 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0936  hypothetical protein  29.58 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0822  hypothetical protein  31.72 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5436  hypothetical protein  30.88 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4677  hypothetical protein  30.87 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.371903  hitchhiker  0.009196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2101  hypothetical protein  29.93 
 
 		 201 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5245  hypothetical protein  44.93 
 
 		 191 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5108  hypothetical protein  30.32 
 
 		 199 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408791  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1751  protein of unknown function DUF664  32.35 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1245  hypothetical protein  28.48 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1196  hypothetical protein  30.19 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.974573  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5699  hypothetical protein  31.17 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0958  hypothetical protein  33.85 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5542  protein of unknown function DUF664  32.87 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0976  hypothetical protein  33.85 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0645805 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0979  hypothetical protein  34.38 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0585  protein of unknown function DUF664  26.9 
 
 		 202 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.106985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5225  hypothetical protein  31.08 
 
 		 204 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5401  protein of unknown function DUF664  30.13 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3868  protein of unknown function DUF664  28.4 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1048  hypothetical protein  26.39 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0247  protein of unknown function DUF664  42.86 
 
 		 211 aa  40.8  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>