86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3866 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3866  protein of unknown function DUF664  100 
 
 
166 aa  329  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542757  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1029  protein of unknown function DUF664  64.47 
 
 
165 aa  203  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0936  hypothetical protein  61.64 
 
 
165 aa  201  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5699  hypothetical protein  62.03 
 
 
165 aa  198  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2662  hypothetical protein  44.52 
 
 
170 aa  123  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0065374  normal  0.130482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0756  hypothetical protein  43.36 
 
 
172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6378  hypothetical protein  40 
 
 
162 aa  100  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1751  protein of unknown function DUF664  36.3 
 
 
163 aa  94.7  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5436  hypothetical protein  36.43 
 
 
176 aa  94.7  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315547  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2390  hypothetical protein  37.82 
 
 
170 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265375  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2084  protein of unknown function DUF664  35.15 
 
 
168 aa  85.9  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.623547  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27380  Protein of unknown function (DUF664)  36.05 
 
 
171 aa  85.1  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2316  hypothetical protein  40.65 
 
 
175 aa  84.3  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.299427  normal  0.014207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1490  protein of unknown function DUF664  37.41 
 
 
175 aa  84  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8812  protein of unknown function DUF664  37.2 
 
 
190 aa  84  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00338165  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7313  hypothetical protein  37.32 
 
 
168 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02080  Protein of unknown function (DUF664)  37.5 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3566  hypothetical protein  35.37 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.527928 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1183  hypothetical protein  38.96 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0476476  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0332  protein of unknown function DUF664  36.18 
 
 
177 aa  77.4  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1293  hypothetical protein  37.01 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315219  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3244  hypothetical protein  36.67 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.062152  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0776  protein of unknown function DUF664  34.62 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2959  hypothetical protein  33.97 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.299373 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5401  protein of unknown function DUF664  35.4 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2169  protein of unknown function DUF664  38.31 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  hitchhiker  0.00138887 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27250  Protein of unknown function (DUF664)  37.9 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119129  normal  0.205212 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1650  protein of unknown function DUF664  35.26 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939726  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0233  protein of unknown function DUF664  36.91 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1764  hypothetical protein  34.53 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.273474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0822  hypothetical protein  28.95 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5084  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6807  hypothetical protein  28.3 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.378283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3198  protein of unknown function DUF664  31.13 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1218  protein of unknown function DUF664  35.51 
 
 
172 aa  63.9  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299691  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21220  Protein of unknown function (DUF664)  36.67 
 
 
179 aa  63.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.087402 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3852  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5542  protein of unknown function DUF664  35.48 
 
 
171 aa  62.4  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0585  protein of unknown function DUF664  35.21 
 
 
202 aa  62  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.106985 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1048  hypothetical protein  29.53 
 
 
187 aa  61.6  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4040  protein of unknown function DUF664  32.52 
 
 
177 aa  61.2  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0247  protein of unknown function DUF664  34.01 
 
 
211 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3868  protein of unknown function DUF664  35.06 
 
 
172 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5165  protein of unknown function DUF664  29.05 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1314  hypothetical protein  34.11 
 
 
191 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8367  protein of unknown function DUF664  36.17 
 
 
198 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1689  protein of unknown function DUF664  32.9 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3380  hypothetical protein  31.69 
 
 
144 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.499473 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1061  protein of unknown function DUF664  32.85 
 
 
169 aa  59.3  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.957525  normal  0.854466 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4677  hypothetical protein  28.93 
 
 
163 aa  58.2  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.371903  hitchhiker  0.009196 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22750  Protein of unknown function (DUF664)  36.67 
 
 
196 aa  58.2  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2210  protein of unknown function DUF664  34.97 
 
 
173 aa  57.8  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0256  protein of unknown function DUF664  35.06 
 
 
204 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0637  protein of unknown function DUF664  30.82 
 
 
195 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0741  protein of unknown function DUF664  31.33 
 
 
196 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0432  hypothetical protein  29.01 
 
 
171 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3296  protein of unknown function DUF664  28.83 
 
 
223 aa  53.9  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461354  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07380  Protein of unknown function (DUF664)  28.36 
 
 
186 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5225  hypothetical protein  30.82 
 
 
204 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3455  protein of unknown function DUF664  32.45 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00229137  hitchhiker  0.00402498 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4006  protein of unknown function DUF664  30.13 
 
 
189 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0339  protein of unknown function DUF664  27.97 
 
 
190 aa  52.4  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0477  protein of unknown function DUF664  30.47 
 
 
186 aa  52.4  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2101  hypothetical protein  31.21 
 
 
201 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2794  protein of unknown function DUF664  30 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127816  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20480  Protein of unknown function (DUF664)  29.69 
 
 
188 aa  48.9  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.247017  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0979  hypothetical protein  30 
 
 
200 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0958  hypothetical protein  30 
 
 
200 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0976  hypothetical protein  30 
 
 
200 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0645805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  30.87 
 
 
396 aa  48.5  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2997  protein of unknown function DUF664  37.84 
 
 
155 aa  48.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0659  protein of unknown function DUF664  34.69 
 
 
192 aa  47.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.689351  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7026  protein of unknown function DUF664  33.33 
 
 
155 aa  47.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.99462  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4136  protein of unknown function DUF664  32.03 
 
 
189 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3489  protein of unknown function DUF664  26.59 
 
 
192 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.920969 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1132  putative mini-circle protein  40.54 
 
 
126 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19820  Protein of unknown function (DUF664)  29.24 
 
 
185 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.867653  hitchhiker  0.00266163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5245  hypothetical protein  29.19 
 
 
191 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5900  hypothetical protein  30.32 
 
 
189 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.575694 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3880  hypothetical protein  30.28 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00585365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5108  hypothetical protein  26.03 
 
 
199 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408791  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1618  hypothetical protein  29.3 
 
 
195 aa  42.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2107  hypothetical protein  28.29 
 
 
204 aa  42  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1245  hypothetical protein  25 
 
 
197 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2899  hypothetical protein  29.61 
 
 
195 aa  41.6  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.792533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3194  protein of unknown function DUF664  26.8 
 
 
165 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.101119 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>