90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07380 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_07380  Protein of unknown function (DUF664)  100 
 
 
186 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1245  hypothetical protein  50 
 
 
197 aa  193  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209232 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5108  hypothetical protein  50.26 
 
 
199 aa  191  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408791  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0958  hypothetical protein  50.26 
 
 
200 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0976  hypothetical protein  50.26 
 
 
200 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0645805 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0979  hypothetical protein  50.26 
 
 
200 aa  177  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1048  hypothetical protein  52.35 
 
 
187 aa  171  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0637  protein of unknown function DUF664  46.52 
 
 
195 aa  147  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0247  protein of unknown function DUF664  45.96 
 
 
211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5165  protein of unknown function DUF664  50 
 
 
175 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5225  hypothetical protein  45.18 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3868  protein of unknown function DUF664  41.82 
 
 
172 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5245  hypothetical protein  42.7 
 
 
191 aa  117  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4040  protein of unknown function DUF664  40.48 
 
 
177 aa  117  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5401  protein of unknown function DUF664  40.96 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0342  protein of unknown function DUF664  39.11 
 
 
202 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0973615  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0081  protein of unknown function DUF664  37.3 
 
 
193 aa  101  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.651534  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19820  Protein of unknown function (DUF664)  37.57 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.867653  hitchhiker  0.00266163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1689  protein of unknown function DUF664  41.36 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0822  hypothetical protein  35.15 
 
 
166 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3380  hypothetical protein  38.76 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.499473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0756  hypothetical protein  38.24 
 
 
172 aa  79  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27250  Protein of unknown function (DUF664)  32.12 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119129  normal  0.205212 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4677  hypothetical protein  34.59 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.371903  hitchhiker  0.009196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2084  protein of unknown function DUF664  34.94 
 
 
168 aa  77  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.623547  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2997  protein of unknown function DUF664  36.88 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6807  hypothetical protein  33.53 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.378283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6378  hypothetical protein  37.5 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0332  protein of unknown function DUF664  35.39 
 
 
177 aa  74.3  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0432  hypothetical protein  33.14 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1218  protein of unknown function DUF664  30.18 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299691  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2210  protein of unknown function DUF664  34.52 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  36.08 
 
 
396 aa  72  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3198  protein of unknown function DUF664  33.13 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1132  putative mini-circle protein  50.65 
 
 
126 aa  70.5  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1029  protein of unknown function DUF664  32.93 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3296  protein of unknown function DUF664  30.22 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461354  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1751  protein of unknown function DUF664  35.71 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2662  hypothetical protein  35.62 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0065374  normal  0.130482 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1490  protein of unknown function DUF664  36.69 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02080  Protein of unknown function (DUF664)  33.33 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3566  hypothetical protein  30.95 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.527928 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5436  hypothetical protein  33.96 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315547  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27380  Protein of unknown function (DUF664)  33.96 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2316  hypothetical protein  33.93 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.299427  normal  0.014207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3244  hypothetical protein  33.13 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.062152  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1293  hypothetical protein  35.19 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315219  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5084  hypothetical protein  31.82 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2959  hypothetical protein  30.18 
 
 
170 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.299373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8367  protein of unknown function DUF664  31.01 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1764  hypothetical protein  32 
 
 
145 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.273474 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21220  Protein of unknown function (DUF664)  33.33 
 
 
179 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.087402 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0339  protein of unknown function DUF664  28.48 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8812  protein of unknown function DUF664  33.74 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00338165  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2169  protein of unknown function DUF664  29.12 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  hitchhiker  0.00138887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2390  hypothetical protein  31.74 
 
 
170 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265375  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5699  hypothetical protein  31.76 
 
 
165 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7313  hypothetical protein  31.58 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1183  hypothetical protein  32.72 
 
 
175 aa  63.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0476476  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0776  protein of unknown function DUF664  32.12 
 
 
173 aa  62.8  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22750  Protein of unknown function (DUF664)  29.41 
 
 
196 aa  62.4  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0256  protein of unknown function DUF664  29.7 
 
 
204 aa  61.6  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1314  hypothetical protein  29.38 
 
 
191 aa  61.6  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3852  hypothetical protein  29.27 
 
 
224 aa  61.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0233  protein of unknown function DUF664  29.48 
 
 
181 aa  59.7  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3455  protein of unknown function DUF664  29.89 
 
 
179 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00229137  hitchhiker  0.00402498 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2794  protein of unknown function DUF664  32.65 
 
 
164 aa  58.9  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127816  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2107  hypothetical protein  27.37 
 
 
204 aa  58.2  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0936  hypothetical protein  28.95 
 
 
165 aa  58.2  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1061  protein of unknown function DUF664  31.45 
 
 
169 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.957525  normal  0.854466 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20480  Protein of unknown function (DUF664)  33.33 
 
 
188 aa  57  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.247017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7026  protein of unknown function DUF664  29.56 
 
 
155 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.99462  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2348  hypothetical protein  40.86 
 
 
93 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5900  hypothetical protein  29.07 
 
 
189 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.575694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3194  protein of unknown function DUF664  32.3 
 
 
165 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.101119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2101  hypothetical protein  27.22 
 
 
201 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1650  protein of unknown function DUF664  30.81 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939726  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0585  protein of unknown function DUF664  26.47 
 
 
202 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.106985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5542  protein of unknown function DUF664  33.73 
 
 
171 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0659  protein of unknown function DUF664  28.37 
 
 
192 aa  52  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.689351  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1618  hypothetical protein  26.16 
 
 
195 aa  51.6  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0477  protein of unknown function DUF664  29.22 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2899  hypothetical protein  25.68 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.792533 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3489  protein of unknown function DUF664  29.34 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.920969 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3866  protein of unknown function DUF664  27.59 
 
 
166 aa  45.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542757  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4136  protein of unknown function DUF664  26.54 
 
 
189 aa  45.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1196  hypothetical protein  61.29 
 
 
174 aa  45.1  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.974573  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  28.23 
 
 
175 aa  44.7  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3935  hypothetical protein  28.57 
 
 
183 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  hitchhiker  0.00874096 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4006  protein of unknown function DUF664  21.38 
 
 
189 aa  42.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>