More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1279 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  100 
 
 
217 aa  437  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  47.32 
 
 
211 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  43.96 
 
 
211 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  53.1 
 
 
253 aa  138  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  45.77 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  42.16 
 
 
210 aa  128  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  49.35 
 
 
243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  40.4 
 
 
218 aa  125  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  40.72 
 
 
198 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  37.81 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  44.06 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  40.49 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  42.16 
 
 
223 aa  112  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
221 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  41.29 
 
 
226 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  38.07 
 
 
227 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  49.64 
 
 
410 aa  106  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  47.89 
 
 
204 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  45.65 
 
 
206 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  36.18 
 
 
197 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  45.86 
 
 
207 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  50 
 
 
217 aa  102  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  43.71 
 
 
196 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  38.19 
 
 
208 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
544 aa  99.8  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  43.28 
 
 
208 aa  98.6  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 
218 aa  98.6  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  33.48 
 
 
227 aa  98.2  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  37.81 
 
 
205 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  37.81 
 
 
205 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  37.81 
 
 
205 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  36.68 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  53.23 
 
 
189 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  34.63 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  39.8 
 
 
221 aa  96.7  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  41.78 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  35.18 
 
 
208 aa  96.3  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  36.22 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  43.8 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  38.5 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  37.5 
 
 
396 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  34.39 
 
 
216 aa  82  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  33.16 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  34.78 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  35.77 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  33.58 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  36.17 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  38.06 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  37.4 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  33.58 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  32.52 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  34.06 
 
 
195 aa  72  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  36.5 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  37.31 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  35.07 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  40.4 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  29.44 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2998  Methyltransferase type 11  48.74 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527605  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2657  Methyltransferase type 11  38.85 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  28.47 
 
 
197 aa  68.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  37.23 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  33.33 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
277 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
167 aa  64.7  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  32.3 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  30.71 
 
 
198 aa  63.2  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 
202 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  29.7 
 
 
201 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  36.13 
 
 
290 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.19 
 
 
262 aa  59.3  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  32.16 
 
 
278 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5356  hypothetical protein  48.48 
 
 
81 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204548  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  22.49 
 
 
207 aa  58.9  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  26.47 
 
 
207 aa  58.9  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  30.28 
 
 
200 aa  58.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  28.36 
 
 
236 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  28.68 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  28.89 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  28.89 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  28.46 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  35 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  28.89 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  48.53 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  28.89 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  31.79 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  36 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 
200 aa  56.6  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  40.62 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  30.16 
 
 
149 aa  56.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 
286 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  28.89 
 
 
236 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  34.97 
 
 
209 aa  56.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  33.33 
 
 
201 aa  55.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  31.65 
 
 
414 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.05 
 
 
253 aa  56.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.13 
 
 
280 aa  55.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>