37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5356 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5356  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204548  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  51.67 
 
 		 218 aa  63.5  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  53.57 
 
 		 214 aa  62  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  48.48 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  54.9 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  59.26 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  46.3 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  51.92 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  51.72 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 253 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  51.92 
 
 		 198 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  48.15 
 
 		 227 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  69.44 
 
 		 189 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  45.28 
 
 		 211 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  49.06 
 
 		 204 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  48.08 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  52.94 
 
 		 410 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  52 
 
 		 223 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  53.33 
 
 		 217 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  40.26 
 
 		 210 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 226 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  48.98 
 
 		 226 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  40.74 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  36.67 
 
 		 208 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  65.71 
 
 		 208 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  47.92 
 
 		 243 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  44 
 
 		 207 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  37.93 
 
 		 227 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  40 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  42.31 
 
 		 205 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  42.31 
 
 		 205 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  42.31 
 
 		 205 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 208 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  69.57 
 
 		 217 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  40.74 
 
 		 206 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>