More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0214 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  100 
 
 
217 aa  424  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  49.02 
 
 
214 aa  171  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  42.79 
 
 
226 aa  148  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  47.32 
 
 
205 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  47.32 
 
 
205 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  47.32 
 
 
205 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  48.57 
 
 
204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  41.98 
 
 
217 aa  138  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  43 
 
 
206 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  41.98 
 
 
208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  44.23 
 
 
206 aa  135  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  47.8 
 
 
221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  41.83 
 
 
208 aa  131  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  40.87 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2657  Methyltransferase type 11  42.72 
 
 
216 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  39.51 
 
 
206 aa  123  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  43.54 
 
 
227 aa  121  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 
243 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  40.49 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  41.95 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  41.38 
 
 
211 aa  116  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  43.46 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  41.26 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  41.55 
 
 
218 aa  108  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  39.74 
 
 
396 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  50 
 
 
217 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  42.65 
 
 
221 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2998  Methyltransferase type 11  44.66 
 
 
203 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527605  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  39.63 
 
 
215 aa  106  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  45.16 
 
 
253 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  51.43 
 
 
210 aa  92.8  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  47.86 
 
 
198 aa  92.8  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  37.63 
 
 
196 aa  92.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  41.1 
 
 
208 aa  91.7  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  39.52 
 
 
227 aa  90.9  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  43.36 
 
 
223 aa  90.1  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  42.66 
 
 
410 aa  89.7  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  42.96 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  42.34 
 
 
197 aa  81.3  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  40.29 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  39.55 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  37.59 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  35.86 
 
 
544 aa  74.7  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  38.85 
 
 
215 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  34.75 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  36.49 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  39.71 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  39.01 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  37.59 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  33.71 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.64 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  41.07 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  37.76 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  34.53 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  36.24 
 
 
199 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  34.8 
 
 
202 aa  62.8  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  36.92 
 
 
198 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  39.39 
 
 
190 aa  62  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  43.14 
 
 
382 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 
233 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  42.16 
 
 
279 aa  61.6  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  34.87 
 
 
246 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  35.56 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  36.18 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  35.97 
 
 
243 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  39.06 
 
 
274 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  41.75 
 
 
271 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  36.49 
 
 
249 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  35.9 
 
 
243 aa  58.5  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 
283 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  31.64 
 
 
196 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3294  Methyltransferase type 11  39.23 
 
 
198 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.216078  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
216 aa  58.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  35.14 
 
 
255 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  30.72 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 
257 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  37.37 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  31.74 
 
 
264 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 
283 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 
363 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.64 
 
 
280 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
282 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
201 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  28.86 
 
 
292 aa  56.6  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  28.07 
 
 
249 aa  56.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5849  Methyltransferase type 12  35.77 
 
 
194 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.13763 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  36.8 
 
 
213 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 
250 aa  55.8  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  33.83 
 
 
541 aa  55.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  35.45 
 
 
262 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  30.81 
 
 
204 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1607  methyltransferase type 11  34.04 
 
 
210 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722742  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
195 aa  55.5  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1553  methyltransferase type 11  34.04 
 
 
210 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920902  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  33.61 
 
 
306 aa  55.5  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
286 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3262  tellurite resistance protein TehB  27.03 
 
 
287 aa  55.5  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 
202 aa  55.1  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  36.89 
 
 
392 aa  54.7  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>