More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0893 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  92.11 
 
 		 190 aa  351  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  54.79 
 
 		 189 aa  204  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  47.06 
 
 		 190 aa  184  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  47.34 
 
 		 196 aa  176  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  40.7 
 
 		 182 aa  104  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  40.88 
 
 		 183 aa  99  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  40.58 
 
 		 202 aa  91.3  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  33.67 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  41.35 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  36.75 
 
 		 181 aa  87.8  9e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  36.23 
 
 		 266 aa  85.9  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  47.42 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  38.89 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  36.96 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  40.6 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  38.52 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  32.64 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  38.81 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  42.86 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  37.58 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  37.35 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  38.24 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  35.34 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  35.56 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  34.78 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  34.23 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  35.26 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  35.26 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  32.09 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  32.09 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  39.26 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  34.97 
 
 		 194 aa  74.3  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  35.82 
 
 		 215 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  35.82 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  34.88 
 
 		 149 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  33.83 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  33.54 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  28.57 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  37.31 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  32.09 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  32.33 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  35.82 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  32.88 
 
 		 173 aa  72  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  32.87 
 
 		 181 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  35.75 
 
 		 191 aa  72  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  32.87 
 
 		 181 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  41.73 
 
 		 168 aa  72  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  37.4 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  30.86 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  37.31 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  32.87 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  32.87 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  33.85 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  31.98 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  31.94 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  31.76 
 
 		 177 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  37.59 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  34.59 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  36.53 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  40.35 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  32.84 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  34.62 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  33.82 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  35.07 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  33.79 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  30.3 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  35.57 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  24.48 
 
 		 277 aa  68.2  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  35.82 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  29.85 
 
 		 167 aa  67  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  32.12 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  28 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2244  tellurite resistance protein TehB  31.34 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.926743  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  32.73 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  37.29 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  35.07 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  32.91 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  35.82 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 290 aa  64.7  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  31.82 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  43.66 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2932  methyltransferase type 12  33.92 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202849  normal  0.0386986 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  31.82 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  34.29 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  35.97 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  31.82 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>