249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1041 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  100 
 
 
167 aa  348  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  80.72 
 
 
221 aa  290  9e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  48.48 
 
 
212 aa  182  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  45.83 
 
 
209 aa  154  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  45.34 
 
 
201 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  40.37 
 
 
201 aa  145  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  45.22 
 
 
208 aa  143  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  45.62 
 
 
207 aa  142  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  44.3 
 
 
204 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  38.51 
 
 
201 aa  136  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  41.72 
 
 
217 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  42.95 
 
 
204 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  40 
 
 
213 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  38.46 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  40 
 
 
213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  37.41 
 
 
195 aa  128  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  40.54 
 
 
197 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  39.46 
 
 
199 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  37.72 
 
 
211 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  37.95 
 
 
235 aa  125  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  39.24 
 
 
198 aa  123  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  36.99 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  37.25 
 
 
198 aa  117  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  35.48 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  35.9 
 
 
194 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  33.33 
 
 
201 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  33.97 
 
 
199 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 
200 aa  105  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  32.47 
 
 
204 aa  103  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  31.41 
 
 
200 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  31.41 
 
 
200 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  33.94 
 
 
207 aa  97.8  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2244  tellurite resistance protein TehB  31.33 
 
 
205 aa  94.7  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.926743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  32.05 
 
 
200 aa  93.6  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  35.66 
 
 
149 aa  92.4  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  31.41 
 
 
207 aa  90.9  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  31.16 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  28.31 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  29.11 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  32.69 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  29.27 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  34.85 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  31.06 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3784  tellurite resistance protein TehB, putative  29.88 
 
 
217 aa  71.2  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100307 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  29.41 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  33.81 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  27.04 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  29.85 
 
 
190 aa  67  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  29.85 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  28.93 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 
202 aa  64.3  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 
216 aa  63.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  27.33 
 
 
210 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  26 
 
 
218 aa  62  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  25.55 
 
 
199 aa  61.6  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  31.51 
 
 
206 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  29.8 
 
 
215 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  27.22 
 
 
204 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  32.14 
 
 
217 aa  58.2  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4951  Methyltransferase type 12  27.97 
 
 
204 aa  57.8  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
290 aa  57.8  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  27.1 
 
 
188 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  28.68 
 
 
184 aa  57.4  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 
227 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  26 
 
 
214 aa  55.1  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  28.47 
 
 
221 aa  54.7  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  24.32 
 
 
243 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  22.97 
 
 
277 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  26.75 
 
 
221 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.21 
 
 
258 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1515  methyltransferase domain-containing protein  28.35 
 
 
200 aa  53.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  30.37 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  31.06 
 
 
258 aa  53.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  26.28 
 
 
226 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  25 
 
 
198 aa  52.4  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  28.32 
 
 
220 aa  52.4  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 
200 aa  52.4  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2608  hypothetical protein  23.65 
 
 
209 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000306401 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  26.11 
 
 
215 aa  51.2  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  33.64 
 
 
243 aa  51.6  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  22.7 
 
 
217 aa  51.2  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  31.62 
 
 
174 aa  51.2  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2368  methyltransferase  23.65 
 
 
209 aa  51.2  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  28.78 
 
 
200 aa  51.2  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00659  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- benzoquinol methylase  32.71 
 
 
250 aa  50.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2978  hypothetical protein  27.14 
 
 
230 aa  50.8  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2593  Methyltransferase type 11  27.14 
 
 
250 aa  50.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  31.25 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 
202 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  30.6 
 
 
174 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  28.7 
 
 
663 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  27.43 
 
 
280 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2413  hypothetical protein  22.97 
 
 
209 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00295431  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2159  Methyltransferase type 12  39.13 
 
 
201 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00432182  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 
250 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.84 
 
 
230 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  26.95 
 
 
196 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  29.85 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.77577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>