More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4970 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 196 aa  395  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  49.5 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  46.88 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  47 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  47.26 
 
 		 227 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  44.28 
 
 		 226 aa  124  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  49.4 
 
 		 410 aa  120  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  42.79 
 
 		 544 aa  118  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  40.67 
 
 		 218 aa  117  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  42.65 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 243 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  37.44 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  42.86 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  40.49 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  40.34 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  45.93 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  40.41 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  43.42 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  37.68 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  38.65 
 
 		 210 aa  97.8  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  43.71 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  41.18 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  38.04 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  38.92 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  41.48 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  38.1 
 
 		 200 aa  91.7  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  40 
 
 		 205 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  40 
 
 		 205 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  40 
 
 		 205 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  42.03 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2657  Methyltransferase type 11  36.93 
 
 		 216 aa  88.2  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 210 aa  88.2  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  40.74 
 
 		 208 aa  85.1  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  38.59 
 
 		 221 aa  84.7  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  36.46 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  33.17 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  45.45 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  38.22 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  38.56 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  38.97 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  41.18 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  38.97 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  34.87 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  31.34 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  36.89 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  35.82 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2998  Methyltransferase type 11  38.15 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527605  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  36.23 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  35.57 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  34.46 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  33.5 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5269  Methyltransferase type 12  35.17 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  29.66 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  34.38 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  45.07 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  34.51 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  35.97 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  42.4 
 
 		 274 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  28.37 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  39.2 
 
 		 249 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  30.64 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.59 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  30.41 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.76 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  25 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  32.84 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  32.31 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  29.2 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 265 aa  54.7  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  33.81 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 149 aa  54.3  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  34.01 
 
 		 226 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  33.09 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  44.44 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  25.76 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.63 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01387  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  26.55 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12360  methyltransferase family protein  39.09 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661079  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2230  tellurite resistance protein TehB  26.55 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.665816 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1511  tellurite resistance protein TehB  26.55 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01398  hypothetical protein  26.55 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  34.71 
 
 		 280 aa  52  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  31.48 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  37.4 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.32 
 
 		 232 aa  51.2  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  30.56 
 
 		 198 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  30.56 
 
 		 198 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  34.06 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>