More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1948 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  100 
 
 
204 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  49.76 
 
 
207 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  55.56 
 
 
200 aa  176  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  52.97 
 
 
208 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  50.74 
 
 
197 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  51.49 
 
 
218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  45.32 
 
 
198 aa  147  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  41.92 
 
 
218 aa  136  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  40 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  41 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  40 
 
 
243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  41.71 
 
 
215 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  40.69 
 
 
210 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  46.08 
 
 
210 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  41.11 
 
 
199 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  41.87 
 
 
215 aa  117  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  40.5 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  37.38 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  38.25 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  38.73 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  39.66 
 
 
199 aa  109  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  37.78 
 
 
201 aa  108  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  35.68 
 
 
204 aa  108  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  36.56 
 
 
253 aa  106  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  37.7 
 
 
200 aa  106  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  41.09 
 
 
227 aa  105  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  43.14 
 
 
208 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  41.87 
 
 
226 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  37.31 
 
 
206 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  40.78 
 
 
208 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  33.33 
 
 
197 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  47.01 
 
 
243 aa  101  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  48.18 
 
 
206 aa  101  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  40.8 
 
 
221 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  43.48 
 
 
214 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  39.9 
 
 
205 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  39.9 
 
 
205 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  39.9 
 
 
205 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  38.42 
 
 
208 aa  98.2  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  38.5 
 
 
217 aa  97.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  37.85 
 
 
194 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  39.9 
 
 
208 aa  96.3  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  37.85 
 
 
194 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  30.3 
 
 
199 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  30.86 
 
 
200 aa  95.1  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  43.54 
 
 
217 aa  95.1  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  29.7 
 
 
201 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  36.23 
 
 
544 aa  93.2  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  32.8 
 
 
198 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  29.38 
 
 
200 aa  92  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  29.38 
 
 
200 aa  92  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2657  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
216 aa  91.7  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  38.64 
 
 
200 aa  91.3  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  36.69 
 
 
200 aa  91.3  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  43.48 
 
 
206 aa  91.3  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  48.2 
 
 
226 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  45.14 
 
 
410 aa  89.4  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  38.31 
 
 
223 aa  88.6  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  37.62 
 
 
196 aa  88.6  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
211 aa  88.2  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  40.88 
 
 
227 aa  88.2  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  41.18 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  38.04 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  38.76 
 
 
189 aa  85.1  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  36.42 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  36.81 
 
 
217 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  36.94 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  38.37 
 
 
209 aa  82  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  35.15 
 
 
208 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  31.12 
 
 
235 aa  79  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  34.98 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  40.8 
 
 
396 aa  79  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  35.71 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  29.76 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 
167 aa  77  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  37.07 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  37.86 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  37.13 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3784  tellurite resistance protein TehB, putative  32.18 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100307 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  42.75 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  38.1 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2244  tellurite resistance protein TehB  27.36 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.926743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2998  Methyltransferase type 11  41.62 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  36.03 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  46.43 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  35.68 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  37.14 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  30.94 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  30.46 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
149 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  34.59 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  35.42 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  36.05 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  34.66 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>