More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2027 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  100 
 
 
198 aa  390  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  54.08 
 
 
227 aa  174  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  55.1 
 
 
226 aa  162  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  49.5 
 
 
196 aa  156  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  49.51 
 
 
218 aa  156  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  51.02 
 
 
223 aa  155  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  46.6 
 
 
208 aa  150  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  46.23 
 
 
221 aa  141  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  43.98 
 
 
243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  46.31 
 
 
210 aa  131  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  45.5 
 
 
544 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  44.55 
 
 
211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  45.32 
 
 
204 aa  129  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  44 
 
 
211 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  50.3 
 
 
410 aa  127  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  50.75 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  46.31 
 
 
253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  44.83 
 
 
204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  41.95 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  43.69 
 
 
214 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  40.72 
 
 
217 aa  115  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  43.63 
 
 
221 aa  115  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  50.32 
 
 
215 aa  112  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  44.31 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  40.3 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  42.5 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  42.65 
 
 
208 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  37.62 
 
 
207 aa  106  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  48.18 
 
 
205 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  48.18 
 
 
205 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  48.18 
 
 
205 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  41.79 
 
 
221 aa  104  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  44.9 
 
 
218 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  42.5 
 
 
208 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  40.1 
 
 
206 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  41.38 
 
 
226 aa  97.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  35.86 
 
 
227 aa  97.4  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  39.41 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  37.82 
 
 
208 aa  95.5  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2657  Methyltransferase type 11  39.71 
 
 
216 aa  91.7  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  38.3 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  37.21 
 
 
396 aa  88.6  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  41.8 
 
 
189 aa  88.2  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  47.14 
 
 
217 aa  84  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  43.06 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  36.41 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2998  Methyltransferase type 11  42.79 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527605  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  41.82 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  33.57 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  34.03 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  35.1 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  34.25 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  36.91 
 
 
202 aa  67  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  33.33 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  31.82 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  32.26 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  34.19 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  32.57 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
216 aa  62  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  31.72 
 
 
190 aa  61.6  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 
226 aa  61.6  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  33.99 
 
 
253 aa  61.6  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  30.95 
 
 
196 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  23.5 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  24.84 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  30.88 
 
 
236 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  28.06 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5269  Methyltransferase type 12  45.79 
 
 
219 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  28.91 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  24.68 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  28.67 
 
 
236 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  28.89 
 
 
236 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  34.06 
 
 
200 aa  59.3  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  27.71 
 
 
229 aa  59.3  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
199 aa  59.3  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
236 aa  58.9  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  28.89 
 
 
236 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  28.89 
 
 
236 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  31.52 
 
 
209 aa  58.9  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  29.01 
 
 
189 aa  59.3  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  28.89 
 
 
236 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  24.84 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  36.09 
 
 
200 aa  59.3  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
207 aa  58.9  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  26.6 
 
 
221 aa  58.5  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  42.06 
 
 
243 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5849  Methyltransferase type 12  35.62 
 
 
194 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.13763 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  28.67 
 
 
222 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  29.33 
 
 
198 aa  58.2  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  32.65 
 
 
183 aa  58.2  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  25.16 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4557  thiopurine S-methyltransferase  39.45 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  25.16 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  27.2 
 
 
149 aa  57.4  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  29.86 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  29.61 
 
 
290 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3243  methyltransferase type 12  30.3 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0787423  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  29.41 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1283  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.73 
 
 
226 aa  56.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>