More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5552 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  100 
 
 		 226 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  77.56 
 
 		 227 aa  318  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  57.5 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  50 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  55.1 
 
 		 198 aa  175  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  55.69 
 
 		 410 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  46.38 
 
 		 544 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  44.88 
 
 		 208 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  44.78 
 
 		 196 aa  131  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  43.72 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  39.8 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  47.21 
 
 		 210 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  40.16 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  39.32 
 
 		 214 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  40.29 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  41.29 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  40.2 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  36.95 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  45.11 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  40.72 
 
 		 197 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  48.67 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  45.59 
 
 		 207 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  43.48 
 
 		 206 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  39.6 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  43.18 
 
 		 200 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  45.33 
 
 		 205 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  45.33 
 
 		 205 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  45.33 
 
 		 205 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  43.07 
 
 		 226 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  40 
 
 		 221 aa  88.6  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  35.29 
 
 		 217 aa  88.2  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  33.97 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  37.44 
 
 		 208 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  36.3 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  41.05 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  50.46 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  31.72 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  39.58 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  35.8 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  35.11 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  34.98 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  37.59 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  37.76 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  35.66 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  35.29 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  40.37 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  34.85 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  30.47 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  38.1 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  32.09 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  35.61 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  37.98 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  30.17 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  32.06 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  30.54 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  30.47 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2657  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  32.88 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  31.82 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  28.79 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2998  Methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3784  tellurite resistance protein TehB, putative  29.55 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100307 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2159  Methyltransferase type 12  31.13 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00432182  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  35.61 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  27.13 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  40.31 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  35.61 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  26.36 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  35.82 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  44.3 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  27.13 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  33.58 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  26.15 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  26.15 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  30.83 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4951  Methyltransferase type 12  28.43 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  32.03 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.46 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  43.52 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  33.92 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.67 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0711  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.45 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0438785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  29.31 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>