204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_67540 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  380  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  97.42 
 
 
194 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  57.73 
 
 
201 aa  204  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  58.55 
 
 
201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  47.94 
 
 
197 aa  188  4e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  51.02 
 
 
198 aa  186  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  53.61 
 
 
199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  50.77 
 
 
195 aa  181  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  49.74 
 
 
200 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  49.22 
 
 
204 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  45.41 
 
 
200 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  42.35 
 
 
200 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  41.54 
 
 
199 aa  158  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  41.54 
 
 
201 aa  157  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  41.58 
 
 
235 aa  149  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  38.46 
 
 
200 aa  148  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  38.46 
 
 
200 aa  148  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  42.56 
 
 
217 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  42.05 
 
 
204 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  39.7 
 
 
207 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  39.8 
 
 
212 aa  141  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
221 aa  138  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  39.59 
 
 
204 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  38.58 
 
 
201 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  41.84 
 
 
213 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  41.92 
 
 
213 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  39.2 
 
 
207 aa  131  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  38.58 
 
 
209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3784  tellurite resistance protein TehB, putative  37.31 
 
 
217 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100307 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  37.06 
 
 
200 aa  129  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  41.62 
 
 
211 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  39.49 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  40.7 
 
 
207 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  44.83 
 
 
149 aa  120  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  39.8 
 
 
198 aa  118  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2244  tellurite resistance protein TehB  33.17 
 
 
205 aa  103  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.926743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  38.16 
 
 
253 aa  89.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  34.48 
 
 
197 aa  89  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  37.5 
 
 
207 aa  87.8  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  36.36 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  32.65 
 
 
218 aa  85.9  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  37.85 
 
 
204 aa  85.1  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  31.79 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  35.82 
 
 
189 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  34.64 
 
 
218 aa  77  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  32.8 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  35.07 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  41.76 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  34.09 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  43.96 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  32.99 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  35.82 
 
 
190 aa  67  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  30.25 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  28.14 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  35.61 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 
243 aa  64.7  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 
216 aa  64.7  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  36.5 
 
 
217 aa  64.3  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 
227 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  34.19 
 
 
220 aa  62.8  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4951  Methyltransferase type 12  35.94 
 
 
204 aa  62  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
215 aa  62  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  33.86 
 
 
410 aa  59.7  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  29.95 
 
 
236 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  32.28 
 
 
236 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  30.94 
 
 
229 aa  58.9  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  35.57 
 
 
168 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  25.9 
 
 
277 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  29.95 
 
 
236 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  34.01 
 
 
251 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  29.73 
 
 
236 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  29.73 
 
 
236 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  29.73 
 
 
236 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  30.85 
 
 
236 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 
198 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  34.01 
 
 
177 aa  55.5  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 
218 aa  55.1  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  29.05 
 
 
222 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  30.32 
 
 
236 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  29.65 
 
 
194 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  34.33 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  30.32 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  36.57 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  29.74 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  30.6 
 
 
177 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  32.03 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  31.14 
 
 
217 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  41.43 
 
 
243 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  29.21 
 
 
183 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 
243 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
209 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  33.1 
 
 
180 aa  51.2  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2159  Methyltransferase type 12  30.43 
 
 
201 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00432182  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  33.1 
 
 
179 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0197  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>