217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2820 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  100 
 
 
180 aa  359  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  357  4e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  48.82 
 
 
200 aa  132  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  46.34 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  39.16 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  36.67 
 
 
202 aa  94  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  40.94 
 
 
183 aa  88.6  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  40.48 
 
 
175 aa  88.2  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  35.96 
 
 
194 aa  86.3  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  38.32 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  42.42 
 
 
190 aa  85.1  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  41.8 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  41.8 
 
 
174 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  39.46 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  35.29 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  39.26 
 
 
174 aa  82  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  35.26 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  36 
 
 
177 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  29.7 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  38.84 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  38.78 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  34.39 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  41.98 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  32.79 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  31.25 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 
202 aa  77.8  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  36.97 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  34.51 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  37.35 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  34.78 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  39.1 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  27.06 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  38.03 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  30.3 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  37.59 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  38.41 
 
 
200 aa  72  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3243  methyltransferase type 12  37.93 
 
 
206 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0787423  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  35.46 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  40.58 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  40.58 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  46.22 
 
 
191 aa  70.9  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  37.86 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  34.38 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  40 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  33.73 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  39.86 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  40 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  28.12 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  40 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  40 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  38.13 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  38.13 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  40 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  33.88 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  33.88 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  33.88 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  33.88 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  36.36 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2562  hypothetical protein  37.31 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0591078  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  37.23 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  38.41 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  34.83 
 
 
208 aa  67.8  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  35.62 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  41.13 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  38.4 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  33.08 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  40.58 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  31.43 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  34.51 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
194 aa  64.3  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  35.54 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  32.97 
 
 
217 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0846  hypothetical protein  36.51 
 
 
173 aa  62.4  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  27.08 
 
 
200 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
220 aa  62.4  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
202 aa  62  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2956  methyltransferase type 12  30.39 
 
 
189 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.311517 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  32.48 
 
 
207 aa  60.8  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  26.11 
 
 
201 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 
216 aa  60.8  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  36.81 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  26.11 
 
 
199 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  31.41 
 
 
208 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  31.11 
 
 
204 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  32.12 
 
 
194 aa  58.5  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  35.33 
 
 
195 aa  58.2  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  24.36 
 
 
200 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  24.36 
 
 
200 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  32.12 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  33.13 
 
 
204 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0991  methyltransferase type 11  34.56 
 
 
182 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13140  hypothetical protein  30.41 
 
 
200 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.225832 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 
189 aa  54.7  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  31.79 
 
 
198 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  33.58 
 
 
211 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  32.14 
 
 
215 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  31.79 
 
 
198 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  31.79 
 
 
198 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  29.01 
 
 
209 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2932  methyltransferase type 12  34.46 
 
 
188 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202849  normal  0.0386986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>