260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4165 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  100 
 
 
177 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  35.98 
 
 
181 aa  80.9  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  31.74 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  35.37 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  30.98 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  35.33 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  31.85 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  36.57 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  32.29 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  33.82 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  33.09 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  31.58 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  32.59 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  31.87 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  33.82 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  36.03 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  36 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  33.55 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  32.12 
 
 
207 aa  64.3  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  35 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  30.69 
 
 
200 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  35.46 
 
 
206 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  31.85 
 
 
190 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  32.31 
 
 
276 aa  62.4  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  29.17 
 
 
194 aa  61.6  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  32.72 
 
 
191 aa  61.6  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  40.37 
 
 
227 aa  61.6  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 
253 aa  61.2  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
208 aa  61.2  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  35.43 
 
 
199 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  40.2 
 
 
220 aa  61.2  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  31.43 
 
 
180 aa  60.8  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  31.43 
 
 
179 aa  60.8  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  33.77 
 
 
168 aa  60.8  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  37.76 
 
 
290 aa  60.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  35.56 
 
 
201 aa  60.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  28.14 
 
 
191 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  40 
 
 
207 aa  60.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  38.46 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  28.19 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  37.5 
 
 
208 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  34.01 
 
 
200 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  29.68 
 
 
183 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  34.65 
 
 
205 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  28.19 
 
 
235 aa  58.9  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  27.41 
 
 
218 aa  58.2  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  34.29 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 
218 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2902  methyltransferase type 12  31.15 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2946  methyltransferase type 12  31.15 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  30 
 
 
188 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2932  methyltransferase type 12  31.15 
 
 
188 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202849  normal  0.0386986 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  36.64 
 
 
245 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  27.52 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  37.78 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  31.32 
 
 
214 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  36.63 
 
 
226 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  32.91 
 
 
204 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  32.61 
 
 
200 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  28.28 
 
 
190 aa  55.1  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  27.52 
 
 
174 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  30.67 
 
 
196 aa  55.1  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  36.03 
 
 
191 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  30.94 
 
 
189 aa  54.7  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  32.88 
 
 
200 aa  54.7  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  29.33 
 
 
188 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  34.56 
 
 
217 aa  54.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  31.34 
 
 
201 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
195 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 
200 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  33.08 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  33.02 
 
 
209 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  33.08 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  32.14 
 
 
200 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  26.67 
 
 
173 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  33.08 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  25.48 
 
 
194 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  30.6 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  39.6 
 
 
208 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  33.08 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  33.08 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  33.08 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  33.08 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  33.08 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 
198 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  27.33 
 
 
177 aa  52.4  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  33.91 
 
 
243 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  29.69 
 
 
195 aa  52.8  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  31.34 
 
 
194 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  27.59 
 
 
194 aa  52.4  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 
199 aa  52.4  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  32.72 
 
 
172 aa  52.4  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
211 aa  52  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 
208 aa  51.6  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  29.22 
 
 
194 aa  51.6  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  29.86 
 
 
195 aa  51.6  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  28.79 
 
 
149 aa  51.2  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  31.68 
 
 
200 aa  51.6  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>