166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0972 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  367  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  78.86 
 
 		 174 aa  296  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  79.43 
 
 		 174 aa  295  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  78.29 
 
 		 174 aa  290  7e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  68.93 
 
 		 181 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  68.93 
 
 		 181 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  68.93 
 
 		 181 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  68.93 
 
 		 181 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  67.05 
 
 		 176 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  56.21 
 
 		 175 aa  192  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  61.59 
 
 		 183 aa  191  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  59.21 
 
 		 173 aa  184  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  53.95 
 
 		 176 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  48.84 
 
 		 174 aa  157  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  41.52 
 
 		 194 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  40.76 
 
 		 168 aa  127  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  41.4 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  42.86 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  39.05 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  38.85 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  42.66 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  42.14 
 
 		 188 aa  101  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2562  hypothetical protein  41.29 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0591078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  40.56 
 
 		 195 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  37.66 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  41.43 
 
 		 188 aa  98.6  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  39.46 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  40.71 
 
 		 200 aa  95.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  38.13 
 
 		 205 aa  94.4  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  36.99 
 
 		 200 aa  94  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  36.99 
 
 		 200 aa  94  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  44.92 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  36.3 
 
 		 200 aa  92.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  36.99 
 
 		 200 aa  92.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  35.03 
 
 		 192 aa  90.1  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  37.14 
 
 		 187 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  35 
 
 		 205 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  36.76 
 
 		 200 aa  89.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  35.62 
 
 		 200 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  35.95 
 
 		 205 aa  89  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  35.85 
 
 		 194 aa  87.8  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  37.14 
 
 		 205 aa  87.4  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  37.14 
 
 		 205 aa  87.4  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 189 aa  87.4  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  37.14 
 
 		 205 aa  87.4  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  37.14 
 
 		 205 aa  87.4  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  33.99 
 
 		 207 aa  87  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  35.88 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  35.29 
 
 		 190 aa  85.5  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  36.23 
 
 		 172 aa  84.7  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  39.83 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0846  hypothetical protein  34.56 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  30.54 
 
 		 276 aa  77.8  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  31.85 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  38.84 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  38.84 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  29.68 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  31.18 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  28.78 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  29.56 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  28.78 
 
 		 190 aa  62  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  30.71 
 
 		 183 aa  62  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  33.53 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  26.32 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  27.41 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  27.22 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  28.28 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  26.82 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  27.78 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  27.78 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  28.39 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  30.82 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  28.37 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  28.17 
 
 		 201 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 202 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  26.76 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  27.33 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  29.82 
 
 		 198 aa  51.6  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  29.82 
 
 		 198 aa  50.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  25.55 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0782  tellurite resistance protein TehB  26.9 
 
 		 286 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0369325  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  28.29 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1779  Methyltransferase type 11  25.14 
 
 		 212 aa  48.9  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 212 aa  48.5  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  29.59 
 
 		 201 aa  48.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  29.86 
 
 		 201 aa  48.1  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1019  tellurite resistance protein TehB  27.01 
 
 		 286 aa  48.1  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.178676  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  29.82 
 
 		 198 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  28.49 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0991  methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 182 aa  48.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  29.24 
 
 		 198 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  29.24 
 
 		 198 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  33.93 
 
 		 259 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0298  methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 263 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  26.12 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  27.7 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>