167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0782 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0782  tellurite resistance protein TehB  100 
 
 
286 aa  605  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0369325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1019  tellurite resistance protein TehB  96.85 
 
 
286 aa  589  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.178676  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3262  tellurite resistance protein TehB  75.17 
 
 
287 aa  472  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0987  tellurite resistance protein TehB  70.28 
 
 
286 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  70.21 
 
 
295 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  70.21 
 
 
295 aa  423  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  70.21 
 
 
295 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  55.21 
 
 
292 aa  332  5e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1558  tellurite resistance protein TehB  55.09 
 
 
291 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  58.33 
 
 
198 aa  240  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  57.29 
 
 
198 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1553  tellurite resistance protein TehB  57.07 
 
 
198 aa  238  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  57.07 
 
 
198 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  57.07 
 
 
198 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2217  tellurite resistance protein TehB  60.21 
 
 
197 aa  236  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1608  tellurite resistance protein TehB  60.21 
 
 
197 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  57.07 
 
 
198 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01387  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  59.69 
 
 
197 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01398  hypothetical protein  59.69 
 
 
197 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1511  tellurite resistance protein TehB  59.69 
 
 
197 aa  236  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2230  tellurite resistance protein TehB  59.69 
 
 
197 aa  236  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.665816 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2035  tellurite resistance protein TehB  59.69 
 
 
197 aa  236  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211796  hitchhiker  1.4996099999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1745  tellurite resistance protein TehB  60.21 
 
 
197 aa  236  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000325665  hitchhiker  3.84687e-20 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1657  tellurite resistance protein TehB  59.69 
 
 
197 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2619  tellurite resistance protein TehB  47.34 
 
 
188 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426631  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2455  tellurite resistance protein TehB  34.71 
 
 
298 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2599  tellurite resistance protein TehB  34.36 
 
 
298 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  28.74 
 
 
184 aa  62.4  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  32.76 
 
 
236 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  27.21 
 
 
196 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  29.48 
 
 
181 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  31.73 
 
 
222 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  32.76 
 
 
236 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  32.76 
 
 
236 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  25 
 
 
194 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  32.76 
 
 
236 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  31.86 
 
 
236 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  32.76 
 
 
236 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  29.91 
 
 
226 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  29.48 
 
 
181 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  30.48 
 
 
236 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  29.48 
 
 
181 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  30.41 
 
 
174 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  29.48 
 
 
181 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  31.86 
 
 
236 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  26.62 
 
 
190 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  32.35 
 
 
173 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
236 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  29.67 
 
 
195 aa  55.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  27.5 
 
 
201 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  29.48 
 
 
174 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2936  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
184 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000191546  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  32.61 
 
 
202 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1288  Methyltransferase type 12  29.92 
 
 
183 aa  52.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.63196e-27 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0330  hypothetical protein  26.92 
 
 
226 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  28.9 
 
 
174 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  26.32 
 
 
209 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2162  hypothetical protein  25.71 
 
 
200 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0386731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  24.11 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  31.63 
 
 
191 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3042  hypothetical protein  29.89 
 
 
97 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.152852 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  24.51 
 
 
290 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  26.9 
 
 
177 aa  50.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  30.52 
 
 
202 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  23.62 
 
 
199 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  29.24 
 
 
183 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1392  hypothetical protein  28.57 
 
 
119 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.701961  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1846  Protein of unknown function DUF1971  28.57 
 
 
119 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  28.32 
 
 
174 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  48.89 
 
 
246 aa  49.7  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0910  hypothetical protein  30.34 
 
 
105 aa  50.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1885  hypothetical protein  28.57 
 
 
119 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2522  hypothetical protein  28.57 
 
 
119 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1836  hypothetical protein  28.57 
 
 
119 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  23.3 
 
 
194 aa  49.7  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  27.61 
 
 
181 aa  49.3  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  29.19 
 
 
183 aa  49.7  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0883  hypothetical protein  24.73 
 
 
111 aa  49.7  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  29.37 
 
 
193 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  28.97 
 
 
189 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5202  hypothetical protein  28.24 
 
 
92 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.335815 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1077  hypothetical protein  23.08 
 
 
112 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.96175  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1110  hypothetical protein  23.08 
 
 
112 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713476 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3281  Protein of unknown function DUF1971  23.08 
 
 
112 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0913902 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4951  Methyltransferase type 12  21.13 
 
 
204 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  30.11 
 
 
195 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1044  Methyltransferase type 11  52.5 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  26.42 
 
 
215 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  23.7 
 
 
243 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  27.22 
 
 
220 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  29.76 
 
 
175 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  27.38 
 
 
208 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4170  hypothetical protein  35.85 
 
 
101 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1008  hypothetical protein  23.08 
 
 
112 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.203602  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  25.47 
 
 
222 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  26.32 
 
 
190 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  24.53 
 
 
201 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  25 
 
 
284 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4807  Methyltransferase type 12  26.47 
 
 
205 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  35.82 
 
 
227 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>