150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3431 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 189 aa  377  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  69.09 
 
 		 195 aa  234  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  64.61 
 
 		 190 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  67.28 
 
 		 194 aa  229  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  58.85 
 
 		 192 aa  225  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  67.27 
 
 		 212 aa  223  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  61.49 
 
 		 209 aa  213  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  55.32 
 
 		 194 aa  210  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  59.34 
 
 		 207 aa  208  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  60.36 
 
 		 188 aa  186  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  58.15 
 
 		 187 aa  186  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  60.84 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2562  hypothetical protein  51.85 
 
 		 195 aa  184  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0591078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  59.17 
 
 		 188 aa  184  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  60.84 
 
 		 205 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  60.84 
 
 		 205 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  60.84 
 
 		 205 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  60.84 
 
 		 205 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  55.61 
 
 		 205 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  60.84 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  58.33 
 
 		 190 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  57.54 
 
 		 191 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  60.24 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  58.33 
 
 		 191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  58.1 
 
 		 195 aa  181  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  57.84 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  54.4 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  57.84 
 
 		 200 aa  171  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  56.38 
 
 		 200 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  56.38 
 
 		 200 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  56.22 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  52.88 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  55.85 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  59.04 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  49.67 
 
 		 172 aa  155  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  51.72 
 
 		 194 aa  152  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0846  hypothetical protein  45.28 
 
 		 173 aa  137  7.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  46.71 
 
 		 177 aa  135  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  40.88 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  35 
 
 		 173 aa  98.2  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  36.91 
 
 		 175 aa  95.1  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  34.93 
 
 		 177 aa  89.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 176 aa  88.2  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  38.97 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  41.07 
 
 		 176 aa  86.3  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  39.07 
 
 		 168 aa  85.5  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  33.77 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  35.77 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  35.77 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  35.77 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  35.77 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  33.11 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  31.67 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  34.21 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  34.51 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  30.22 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  32.26 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  28.12 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  30.16 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  31.65 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  31.01 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  31.69 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  35.59 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  30.11 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 202 aa  62  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  34.4 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  32.8 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  31.97 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  29.25 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  23.12 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  29.77 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  41.84 
 
 		 257 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  30.67 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  22.5 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  30.67 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  28.15 
 
 		 182 aa  51.6  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0991  methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 182 aa  52  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  22.36 
 
 		 200 aa  51.6  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  20.13 
 
 		 200 aa  51.2  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  20.13 
 
 		 200 aa  51.2  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  38.02 
 
 		 304 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  41.82 
 
 		 255 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  31.87 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 251 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 222 aa  48.9  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  31.39 
 
 		 177 aa  48.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  33.06 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  41.03 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 236 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0379  methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 257 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.292052  normal  0.0841223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2699  methyltransferase type 12  38.78 
 
 		 231 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  37.31 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  32.05 
 
 		 290 aa  45.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 246 aa  45.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>