172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2562 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2562  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  390  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0591078  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  63.87 
 
 
188 aa  208  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  63.35 
 
 
188 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  60.99 
 
 
195 aa  206  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  59.69 
 
 
190 aa  204  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  56.07 
 
 
212 aa  192  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  53.47 
 
 
192 aa  188  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  52.97 
 
 
190 aa  188  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  52.43 
 
 
194 aa  186  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  58.58 
 
 
195 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  52.58 
 
 
209 aa  185  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  57.75 
 
 
191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  51.85 
 
 
189 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  50.5 
 
 
207 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  54.01 
 
 
205 aa  180  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  46.73 
 
 
194 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  56.45 
 
 
200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  54.3 
 
 
200 aa  167  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  56.99 
 
 
200 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  54.02 
 
 
187 aa  166  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  54.84 
 
 
200 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  54.3 
 
 
200 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  54.3 
 
 
200 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  52.69 
 
 
205 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  52.69 
 
 
205 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  52.69 
 
 
205 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  52.69 
 
 
205 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  52.69 
 
 
205 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  52.69 
 
 
205 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  54.01 
 
 
191 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  51.61 
 
 
205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  53.76 
 
 
200 aa  161  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  48.74 
 
 
200 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  50 
 
 
194 aa  157  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  47.52 
 
 
199 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  50.32 
 
 
172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  46.43 
 
 
177 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0846  hypothetical protein  41.57 
 
 
173 aa  124  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  41.29 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  42.86 
 
 
174 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  42.86 
 
 
174 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  39.86 
 
 
181 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  39.86 
 
 
181 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  39.86 
 
 
181 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  39.86 
 
 
181 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  42.45 
 
 
174 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  43.57 
 
 
176 aa  101  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  40 
 
 
176 aa  97.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  39.31 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  38.35 
 
 
173 aa  97.1  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  38.19 
 
 
175 aa  93.6  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  39.6 
 
 
174 aa  93.6  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  39.13 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  35.76 
 
 
194 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  32.24 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  35.48 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  30.22 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  37.31 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  37.31 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  37.06 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  33.09 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  32.76 
 
 
188 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  33.33 
 
 
202 aa  62  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  31.79 
 
 
190 aa  61.2  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  32.24 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  28.86 
 
 
189 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  33.9 
 
 
181 aa  58.5  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  31.3 
 
 
190 aa  58.2  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  32.84 
 
 
193 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  27.54 
 
 
177 aa  55.1  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2535  methyltransferase type 12  29.6 
 
 
200 aa  53.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  0.207866 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2599  tellurite resistance protein TehB  28.08 
 
 
298 aa  52  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2455  tellurite resistance protein TehB  28.08 
 
 
298 aa  51.6  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5050  metW protein  32.71 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0473  methionine biosynthesis MetW  32.71 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  38.36 
 
 
319 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  32.58 
 
 
183 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  27.19 
 
 
390 aa  48.9  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
202 aa  48.5  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  33.8 
 
 
207 aa  48.1  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1426  methionine biosynthesis protein MetW  35.71 
 
 
229 aa  47.8  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 
246 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  33.88 
 
 
236 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
246 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 
244 aa  47  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0222  methionine biosynthesis MetW  39.19 
 
 
206 aa  46.6  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  37.37 
 
 
257 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  29.29 
 
 
182 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  36 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  33.63 
 
 
254 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  36.11 
 
 
245 aa  46.2  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  31.63 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
246 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 
219 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
247 aa  46.2  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  38.03 
 
 
200 aa  46.6  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5098  methionine biosynthesis protein MetW  33.64 
 
 
212 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  26.14 
 
 
263 aa  45.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5148  methionine biosynthesis protein MetW  33.64 
 
 
206 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.740945  normal  0.654734 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>