116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2716 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  349  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  53.89 
 
 
200 aa  174  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  55.09 
 
 
205 aa  173  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  56.1 
 
 
194 aa  173  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  54.49 
 
 
200 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  52.69 
 
 
199 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  53.33 
 
 
200 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  55.29 
 
 
191 aa  166  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  52.12 
 
 
200 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  52.12 
 
 
200 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0846  hypothetical protein  52.5 
 
 
173 aa  165  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  54.55 
 
 
188 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  52.12 
 
 
200 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  50.9 
 
 
205 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  50.9 
 
 
205 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  53.94 
 
 
188 aa  164  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  50.3 
 
 
205 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  50.9 
 
 
205 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  50.9 
 
 
205 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  50.9 
 
 
205 aa  163  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  50.9 
 
 
205 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  55.15 
 
 
200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  52.12 
 
 
200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  54.55 
 
 
191 aa  160  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  50.3 
 
 
187 aa  160  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  50.3 
 
 
195 aa  158  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  50.89 
 
 
190 aa  157  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  50.88 
 
 
207 aa  156  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  48.24 
 
 
212 aa  155  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  49.67 
 
 
189 aa  151  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  49.7 
 
 
209 aa  150  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  48.7 
 
 
195 aa  147  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  46.71 
 
 
190 aa  140  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  45.56 
 
 
194 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  46.05 
 
 
194 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  48.5 
 
 
177 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2562  hypothetical protein  50.32 
 
 
195 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0591078  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  42.11 
 
 
192 aa  127  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  41.94 
 
 
183 aa  93.6  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  41.83 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  35.62 
 
 
173 aa  89  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  38.13 
 
 
181 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  38.13 
 
 
181 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  38.13 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  38.13 
 
 
181 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  39.1 
 
 
174 aa  85.5  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  41.88 
 
 
176 aa  85.5  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  36.23 
 
 
177 aa  84.7  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  34.16 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  38.35 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  38.35 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  39.5 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  36.43 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  36.24 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  38.51 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  34.59 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  33.99 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  32.64 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  33.96 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  36.36 
 
 
179 aa  67.4  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  36.36 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  35.14 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  30.14 
 
 
276 aa  64.7  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  35.44 
 
 
188 aa  57.8  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  33.12 
 
 
182 aa  57.4  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  32.35 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0991  methyltransferase type 11  33.77 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  32.09 
 
 
189 aa  55.1  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  33.11 
 
 
215 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  32.72 
 
 
177 aa  52.4  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  27.71 
 
 
191 aa  52.4  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  33.06 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  31.1 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29824  predicted protein  29.88 
 
 
358 aa  49.7  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  33.83 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  31.9 
 
 
202 aa  49.3  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
218 aa  48.5  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  30.3 
 
 
190 aa  48.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 
202 aa  47.8  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  32.03 
 
 
204 aa  47.4  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 
319 aa  47.4  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  31.1 
 
 
183 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  34.56 
 
 
291 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  32.89 
 
 
200 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  27.35 
 
 
197 aa  44.3  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  23.74 
 
 
200 aa  44.3  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  23.74 
 
 
200 aa  44.3  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.35 
 
 
250 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  31.85 
 
 
204 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  36.99 
 
 
292 aa  43.9  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  31.16 
 
 
217 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1583  methyltransferase type 11  29.91 
 
 
197 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.634707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1607  methyltransferase type 11  29.82 
 
 
210 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722742  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  28.33 
 
 
221 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5849  Methyltransferase type 12  42.86 
 
 
194 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.13763 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1553  methyltransferase type 11  29.82 
 
 
210 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920902  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  23.57 
 
 
200 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  31.53 
 
 
253 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
216 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>