225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1144 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  374  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  80.75 
 
 		 188 aa  299  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  79.14 
 
 		 188 aa  295  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  64.32 
 
 		 200 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  64.86 
 
 		 200 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  63.24 
 
 		 200 aa  218  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  65.7 
 
 		 199 aa  218  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  65.19 
 
 		 200 aa  217  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  64.64 
 
 		 200 aa  217  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  64.64 
 
 		 200 aa  217  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  65.52 
 
 		 205 aa  214  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  63.95 
 
 		 200 aa  214  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  61.76 
 
 		 191 aa  213  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  62.57 
 
 		 187 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  62.29 
 
 		 205 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  62.16 
 
 		 200 aa  211  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  62.43 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  62.43 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  62.43 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  62.43 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  62.29 
 
 		 205 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  61.85 
 
 		 205 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  62.57 
 
 		 191 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2562  hypothetical protein  59.16 
 
 		 195 aa  192  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0591078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  59.65 
 
 		 212 aa  191  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  59.54 
 
 		 195 aa  190  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  61.68 
 
 		 195 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  58.33 
 
 		 189 aa  178  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  55.25 
 
 		 192 aa  177  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  50.27 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  56.02 
 
 		 190 aa  175  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  55.42 
 
 		 194 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  52 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  51.7 
 
 		 209 aa  160  8.000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  56.02 
 
 		 194 aa  157  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  50.89 
 
 		 172 aa  157  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  49.7 
 
 		 177 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0846  hypothetical protein  49.06 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  46.67 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  37.13 
 
 		 174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  40.79 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  41.94 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  41.4 
 
 		 177 aa  108  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  38.41 
 
 		 174 aa  108  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  46.4 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  45.83 
 
 		 175 aa  100  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  34.73 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  34.73 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  34.73 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  37.16 
 
 		 181 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  42.45 
 
 		 176 aa  94.7  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  45.11 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  36.47 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  42.42 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  42.42 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  40.4 
 
 		 168 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  34.33 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  39.08 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  36.36 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  30.95 
 
 		 276 aa  75.1  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  33.33 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  38.85 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  35.71 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  36.91 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  29.63 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  34.56 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  34.96 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  34.86 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  31.85 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  36.42 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  35.59 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  32.05 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  27.78 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  33.61 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  30.67 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 319 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  31.39 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  31.91 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  40.65 
 
 		 252 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 304 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  31.9 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  34.31 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2790  methyltransferase, putative  35.46 
 
 		 324 aa  48.9  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.383321  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  64.52 
 
 		 255 aa  48.9  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1426  methionine biosynthesis protein MetW  35.37 
 
 		 229 aa  48.9  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  23.08 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  23.08 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  35.24 
 
 		 198 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5849  Methyltransferase type 12  32.7 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13763 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  35.24 
 
 		 198 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  28.17 
 
 		 541 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  28.17 
 
 		 541 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  35.24 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  29.29 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  29.28 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0222  methionine biosynthesis MetW  34.07 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>