107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1011 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  100 
 
 
194 aa  388  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  96.84 
 
 
190 aa  370  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  62.43 
 
 
209 aa  222  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  66.67 
 
 
195 aa  222  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  67.28 
 
 
189 aa  221  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  59.36 
 
 
192 aa  218  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  60.44 
 
 
212 aa  214  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  62.07 
 
 
207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  59.88 
 
 
194 aa  211  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  57.39 
 
 
205 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  57.39 
 
 
205 aa  185  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  59.15 
 
 
205 aa  184  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  59.76 
 
 
205 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  59.76 
 
 
205 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  59.76 
 
 
205 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  59.76 
 
 
205 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2562  hypothetical protein  51.89 
 
 
195 aa  181  6e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0591078  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  56.73 
 
 
187 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  57.93 
 
 
200 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  57.93 
 
 
200 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  54.35 
 
 
205 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  57.93 
 
 
200 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  57.32 
 
 
200 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  57.32 
 
 
188 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  52.91 
 
 
195 aa  175  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  55.42 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  57.32 
 
 
188 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  54.07 
 
 
191 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  56.44 
 
 
200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  57.93 
 
 
200 aa  170  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  52 
 
 
200 aa  170  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  57.32 
 
 
200 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  51.43 
 
 
199 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  52.63 
 
 
191 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  46.05 
 
 
172 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  44 
 
 
194 aa  139  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0846  hypothetical protein  42.69 
 
 
173 aa  130  9e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  44.85 
 
 
177 aa  128  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  37.72 
 
 
183 aa  104  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  36.76 
 
 
173 aa  93.2  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  39.46 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  37.74 
 
 
174 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  37.31 
 
 
175 aa  89.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  37.74 
 
 
174 aa  88.6  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  37.74 
 
 
174 aa  88.6  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  35.88 
 
 
177 aa  86.3  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  38.06 
 
 
176 aa  85.5  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  31.98 
 
 
194 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  37.74 
 
 
181 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  39.42 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  39.42 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  39.42 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  31.54 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  33.15 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  39.29 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  34.85 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  34.81 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  33.77 
 
 
168 aa  72  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0991  methyltransferase type 11  34.44 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  30.92 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  31.25 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  30.41 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  30.43 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  31.03 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  30.71 
 
 
276 aa  63.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
202 aa  62  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  28.14 
 
 
202 aa  61.6  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
188 aa  61.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  35.83 
 
 
190 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  31.09 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  30.63 
 
 
189 aa  57.8  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  31.21 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  30.99 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  32.12 
 
 
180 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  32.12 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  27.59 
 
 
177 aa  52.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3328  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  34.5 
 
 
210 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1019  tellurite resistance protein TehB  27.92 
 
 
286 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.178676  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5324  methionine biosynthesis MetW  33.71 
 
 
206 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2956  methyltransferase type 12  30.82 
 
 
189 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.311517 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5050  metW protein  34.44 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0473  methionine biosynthesis MetW  34.44 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  32.88 
 
 
221 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  23.76 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
257 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2902  methyltransferase type 12  33.56 
 
 
183 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0379  methyltransferase type 11  41.54 
 
 
257 aa  43.1  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.292052  normal  0.0841223 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2946  methyltransferase type 12  33.56 
 
 
183 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2932  methyltransferase type 12  33.56 
 
 
188 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202849  normal  0.0386986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  42.11 
 
 
319 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  28.24 
 
 
207 aa  42.4  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0782  tellurite resistance protein TehB  27.27 
 
 
286 aa  42.4  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0369325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  20.92 
 
 
200 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  20.92 
 
 
200 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
196 aa  42  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0488  methionine biosynthesis protein MetW  31.46 
 
 
206 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  41.86 
 
 
203 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  37.7 
 
 
245 aa  42  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05070  putative methionine biosynthesis protein  31.46 
 
 
206 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>