156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0785 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  100 
 
 		 176 aa  363  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  57.71 
 
 		 175 aa  197  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  52.81 
 
 		 183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  53.85 
 
 		 173 aa  168  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  51.48 
 
 		 174 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  51.48 
 
 		 174 aa  166  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  51.16 
 
 		 174 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  53.95 
 
 		 177 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  48.82 
 
 		 181 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  52.32 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  52.32 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  53.38 
 
 		 176 aa  159  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  52.32 
 
 		 181 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  49.06 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  36.51 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  45.52 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  46.22 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  46.4 
 
 		 190 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  44.62 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  37.65 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  38.75 
 
 		 199 aa  104  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  44.54 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  42.76 
 
 		 200 aa  103  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  45.31 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  41.67 
 
 		 168 aa  100  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  39.04 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  41.35 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  41.45 
 
 		 200 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  41.45 
 
 		 200 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  41.45 
 
 		 200 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  45.97 
 
 		 192 aa  97.8  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  39.29 
 
 		 200 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  45.61 
 
 		 191 aa  97.1  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  44.03 
 
 		 200 aa  97.1  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  41.84 
 
 		 205 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  44.62 
 
 		 205 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  44.62 
 
 		 205 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  44.62 
 
 		 205 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  44.62 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  44.62 
 
 		 205 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  43.41 
 
 		 200 aa  94.4  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  39.37 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  43.85 
 
 		 205 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  43.85 
 
 		 187 aa  92.8  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  39.86 
 
 		 207 aa  91.3  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 209 aa  89.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2562  hypothetical protein  39.33 
 
 		 195 aa  89.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0591078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  43.38 
 
 		 194 aa  88.6  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  40.31 
 
 		 200 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  41.88 
 
 		 172 aa  85.5  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  40.74 
 
 		 194 aa  85.1  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  85.1  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  41.07 
 
 		 189 aa  85.5  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  38.06 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0846  hypothetical protein  41.59 
 
 		 173 aa  85.1  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  32.87 
 
 		 184 aa  84.7  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  38.06 
 
 		 190 aa  84.7  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  32.87 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  34.39 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  34.39 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  33.56 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  33.51 
 
 		 200 aa  72  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  34.25 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  31.85 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  30.3 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  29.7 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  34.42 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  33.55 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  31.94 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  31.93 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  33.99 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  31.25 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  30.47 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  29.87 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  27.39 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  27.39 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  26.17 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  30.34 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  29.85 
 
 		 200 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  29.41 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  30.61 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  28.77 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  33.12 
 
 		 238 aa  48.1  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  29.58 
 
 		 198 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29824  predicted protein  23.65 
 
 		 358 aa  48.1  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  28.46 
 
 		 182 aa  47.8  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  30.28 
 
 		 198 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  30.43 
 
 		 198 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  30.43 
 
 		 198 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  27.05 
 
 		 255 aa  47.4  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  28.25 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0991  methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  28.26 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  29.55 
 
 		 215 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1622  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32 
 
 		 407 aa  46.2  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.254122 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>