237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1103 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  72.63 
 
 
191 aa  278  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  58.2 
 
 
200 aa  208  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  59.79 
 
 
200 aa  208  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  62.57 
 
 
190 aa  207  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  60.22 
 
 
188 aa  206  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  59.12 
 
 
188 aa  204  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  58.2 
 
 
200 aa  204  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  58.2 
 
 
200 aa  204  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  57.89 
 
 
200 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  56.02 
 
 
205 aa  201  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  57.89 
 
 
200 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  57.92 
 
 
187 aa  198  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  64.67 
 
 
195 aa  197  7.999999999999999e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  56.68 
 
 
199 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  56.32 
 
 
205 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  56.32 
 
 
205 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  57.38 
 
 
205 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  55.56 
 
 
200 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  57.38 
 
 
205 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  57.38 
 
 
205 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  57.38 
 
 
205 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  57.38 
 
 
205 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  52.74 
 
 
209 aa  189  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  54.01 
 
 
200 aa  185  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  53.37 
 
 
207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  58.33 
 
 
189 aa  181  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  51.03 
 
 
192 aa  174  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  56.1 
 
 
212 aa  174  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  49.19 
 
 
194 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  53.22 
 
 
190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  52.63 
 
 
194 aa  170  9e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  54.55 
 
 
172 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  54.65 
 
 
194 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0846  hypothetical protein  51.83 
 
 
173 aa  162  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2562  hypothetical protein  53.48 
 
 
195 aa  159  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0591078  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  50.26 
 
 
195 aa  157  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  48.81 
 
 
177 aa  148  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  42.11 
 
 
183 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  40.14 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  36.75 
 
 
173 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  40.85 
 
 
174 aa  109  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  40.14 
 
 
174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  40.77 
 
 
175 aa  104  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  45.61 
 
 
176 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  44.92 
 
 
177 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  45.99 
 
 
174 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  40.85 
 
 
181 aa  98.6  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  40.85 
 
 
181 aa  98.6  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  40.85 
 
 
181 aa  98.6  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  40.14 
 
 
181 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  44.35 
 
 
176 aa  91.7  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  36.09 
 
 
194 aa  88.6  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  34.84 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  34.9 
 
 
195 aa  85.5  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  36.87 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  41.56 
 
 
168 aa  82  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  35.75 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  34.07 
 
 
184 aa  79  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  39.58 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  38.56 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  36.92 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  33.56 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  32.32 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  46.22 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  46.22 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  31.54 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  36.29 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  35.8 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  26.06 
 
 
276 aa  68.2  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  35.76 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  34.31 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  36.03 
 
 
177 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  33.6 
 
 
195 aa  60.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 
216 aa  57  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  34.33 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  32.32 
 
 
200 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
211 aa  54.7  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  34.81 
 
 
215 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  41.35 
 
 
319 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  32.68 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
222 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  41.67 
 
 
252 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0991  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
182 aa  52.4  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 
252 aa  51.2  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  30.37 
 
 
220 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 
250 aa  50.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 
286 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  29.52 
 
 
245 aa  50.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  35.77 
 
 
208 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4628  MCP methyltransferase, CheR-type  35.54 
 
 
241 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 
250 aa  48.9  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
196 aa  48.9  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2535  methyltransferase type 12  34.21 
 
 
200 aa  48.9  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  0.207866 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4409  methyltransferase type 11  33.09 
 
 
205 aa  48.9  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 
255 aa  48.5  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  28.86 
 
 
575 aa  48.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2671  SAM-dependent methyltransferase  29.27 
 
 
193 aa  48.1  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
212 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>