More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4628 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4628  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 241 aa  487  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3410  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.611266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0911  Methyltransferase type 11  29.15 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0484  hypothetical protein  37.5 
 
 		 138 aa  96.3  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.873682  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0895  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0858242  normal  0.196443 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  35.55 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  34.6 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4681  hypothetical protein  25.68 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740312  hitchhiker  1.6173199999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  39.05 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.14 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  34.73 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.14 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  30 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  37.07 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.57 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0656  hypothetical protein  25.68 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0241729  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.96 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  32 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  38.02 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  31 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  37.41 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  39.82 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2104  Methyltransferase type 11  35.33 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0094319  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  36.75 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4321  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.1 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701577  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  41.57 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.29 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2534  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.48 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  36.75 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  34.53 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  36.75 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  36.75 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4215  methyltransferase type 12  37.8 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.515794  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  36.75 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  36.75 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  36.75 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0529  methyltransferase  25.65 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  34.39 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  37.17 
 
 		 541 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  36.28 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  37.17 
 
 		 541 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1309  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.97 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  35.9 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.52 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.79 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0533  methyltransferase type 11  25.68 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3965  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.65 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3819  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.14 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0687  hypothetical protein  25.33 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  36.28 
 
 		 541 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  40.38 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.52 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  36.28 
 
 		 541 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  32.7 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.23 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  40.66 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4029  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.61 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2136  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  39.82 
 
 		 457 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000408941 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.05 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.14 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204476  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.51 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1742  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.45 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.51 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  31.91 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  37.29 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  39.84 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3002  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.17 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.4 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0747  hypothetical protein  32.98 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000483257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0674  hypothetical protein  25.11 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30135e-22 
 
 
-
 
NC_004310  BR1872  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466783  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1803  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0795517  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  35.4 
 
 		 541 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2752  hypothetical protein  32.86 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  35.43 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.02 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>