118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2133 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  100 
 
 		 200 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  96 
 
 		 200 aa  360  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  89.5 
 
 		 200 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  89.5 
 
 		 200 aa  352  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  89.5 
 
 		 200 aa  352  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  89 
 
 		 200 aa  351  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  88 
 
 		 200 aa  345  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  75.52 
 
 		 205 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  75 
 
 		 205 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  76.22 
 
 		 205 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  76.22 
 
 		 205 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  76.22 
 
 		 205 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  76.22 
 
 		 205 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  74.59 
 
 		 205 aa  272  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  74.05 
 
 		 187 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  67.71 
 
 		 205 aa  254  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  67.91 
 
 		 200 aa  245  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  66.84 
 
 		 199 aa  239  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  67.96 
 
 		 188 aa  237  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  66.3 
 
 		 188 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  64.32 
 
 		 190 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  58.24 
 
 		 191 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  55.05 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  57.89 
 
 		 191 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  57.61 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  57.23 
 
 		 212 aa  180  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  54.49 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  57.06 
 
 		 190 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  56.44 
 
 		 194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  56.8 
 
 		 195 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  56.22 
 
 		 189 aa  167  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  51.91 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  52.84 
 
 		 194 aa  165  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  52.78 
 
 		 195 aa  162  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2562  hypothetical protein  55.91 
 
 		 195 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0591078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  53.04 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  50 
 
 		 177 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0846  hypothetical protein  49.07 
 
 		 173 aa  151  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  35.37 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  43.41 
 
 		 176 aa  94.4  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  33.12 
 
 		 183 aa  94.4  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  34.97 
 
 		 175 aa  93.6  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  38.52 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  34.71 
 
 		 174 aa  91.7  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 181 aa  91.7  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  35.06 
 
 		 174 aa  91.3  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  38.03 
 
 		 181 aa  91.3  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  38.03 
 
 		 181 aa  91.3  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  38.03 
 
 		 181 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  36.2 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  41.32 
 
 		 174 aa  89.4  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  35.62 
 
 		 177 aa  89.4  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  36.43 
 
 		 194 aa  84.7  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  35.85 
 
 		 200 aa  85.1  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  38.96 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  35.71 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  38.3 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  39.06 
 
 		 176 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  32.43 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  31.85 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  33.33 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  35.46 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  38.41 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  38.41 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  34.39 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  36.24 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  33.59 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  28.81 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0991  methyltransferase type 11  35 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  33.54 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  30.25 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  29.84 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  30.97 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  32.61 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29824  predicted protein  32.61 
 
 		 358 aa  53.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  24.48 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  32.14 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  31.43 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  33.08 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  24.65 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  24.65 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  24.38 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  28.74 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  24.2 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  23.08 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  30.13 
 
 		 216 aa  48.1  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  34.62 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  29.49 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  32.72 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  35.76 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1848  hypothetical protein  36.26 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 319 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  26.71 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>