101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0907 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  100 
 
 
176 aa  363  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  69.59 
 
 
181 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  69.59 
 
 
181 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  69.59 
 
 
181 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  69.59 
 
 
181 aa  248  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  67.05 
 
 
177 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  68.79 
 
 
174 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  68.21 
 
 
174 aa  241  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  68.79 
 
 
174 aa  240  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  58.43 
 
 
175 aa  191  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  58.11 
 
 
183 aa  175  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  55.33 
 
 
173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  53.38 
 
 
176 aa  159  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  49.42 
 
 
174 aa  148  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  41.42 
 
 
194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  39.35 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  44.72 
 
 
177 aa  99.8  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  46.67 
 
 
195 aa  96.3  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  42.45 
 
 
190 aa  94.7  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2562  hypothetical protein  42.86 
 
 
195 aa  95.1  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0591078  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  35.96 
 
 
191 aa  92.8  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  40.94 
 
 
195 aa  90.1  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  41.73 
 
 
212 aa  90.5  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  36.84 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  37.59 
 
 
194 aa  89.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  38.51 
 
 
199 aa  89  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  36.18 
 
 
188 aa  87.8  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
189 aa  87  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  39.74 
 
 
194 aa  84  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  36.91 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  44.35 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  38.03 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  38.41 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  38.41 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  38.41 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  37.65 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  36.5 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  39.29 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  39.29 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  38.14 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  33.53 
 
 
205 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  36.88 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  36.96 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  36.96 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  36.96 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  36.96 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
207 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  30.41 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  36.23 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0846  hypothetical protein  39.47 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  39.5 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  35.21 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  39.06 
 
 
200 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  33.99 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  31.07 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  28.8 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  30 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  29.3 
 
 
200 aa  64.3  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  30 
 
 
183 aa  61.2  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  32.72 
 
 
190 aa  59.3  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  35.54 
 
 
180 aa  58.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  35.54 
 
 
179 aa  58.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  32.3 
 
 
190 aa  58.2  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  30.16 
 
 
195 aa  55.8  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
189 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  31.87 
 
 
202 aa  54.7  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  31.43 
 
 
182 aa  54.7  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  29.14 
 
 
190 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  28.92 
 
 
201 aa  52.4  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  22.64 
 
 
200 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  22.64 
 
 
200 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  29.8 
 
 
191 aa  52  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  30.56 
 
 
209 aa  51.2  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  25.87 
 
 
199 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  25.87 
 
 
201 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  26.74 
 
 
188 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  23.24 
 
 
200 aa  48.5  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 
266 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 
200 aa  48.1  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29824  predicted protein  25 
 
 
358 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  28.12 
 
 
196 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  32.62 
 
 
195 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1558  tellurite resistance protein TehB  26.06 
 
 
291 aa  45.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0782  tellurite resistance protein TehB  26.95 
 
 
286 aa  45.1  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0369325  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
239 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  33.02 
 
 
259 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1622  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  35.44 
 
 
407 aa  42.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.254122 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  26.28 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  36.62 
 
 
246 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  39.74 
 
 
218 aa  42.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  40 
 
 
200 aa  42  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 
200 aa  41.6  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  29.06 
 
 
206 aa  41.2  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4471  methyltransferase type 11  22.1 
 
 
214 aa  41.2  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00423193 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.13 
 
 
244 aa  41.2  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  28.89 
 
 
207 aa  41.2  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1019  tellurite resistance protein TehB  25.75 
 
 
286 aa  41.2  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.178676  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 
202 aa  41.2  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  26.9 
 
 
177 aa  40.8  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>