More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0217 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  100 
 
 		 200 aa  412  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2614  methyltransferase small  58.21 
 
 		 202 aa  225  4e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1845  methyltransferase small  56.16 
 
 		 203 aa  224  6e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2083  methyltransferase small  53.47 
 
 		 204 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2169  methyltransferase small  55.72 
 
 		 202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1437  methyltransferase  52.15 
 
 		 203 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0529  methyltransferase small  47.26 
 
 		 211 aa  168  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0006  methyltransferase small  46.19 
 
 		 209 aa  158  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1635  methyltransferase  47.47 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2486  putative RNA methylase  45.1 
 
 		 207 aa  154  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0651  methyltransferase related protein  40 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1798  hypothetical protein  42.79 
 
 		 219 aa  145  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1507  methyltransferase small  39.23 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.113673  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1492  methyltransferase small  43.84 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3583  Methyltransferase type 11  40.38 
 
 		 215 aa  131  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0202  methyltransferase small  35.51 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1709  SAM-binding motif-containing protein  35.05 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0891  methyltransferase  35.51 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0317  DNA methylase  34.33 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0520  methyltransferase small  34.78 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2885  Methyltransferase type 11  32.51 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0731  methyltransferase  38.69 
 
 		 192 aa  92.8  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.557885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89455  predicted protein  35.78 
 
 		 273 aa  90.5  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0270328  hitchhiker  0.00142671 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0577  putative RNA methylase  33.5 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0475078  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0236  methyltransferase  32 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.140784 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2199  methyltransferase small  32.31 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0747  methyltransferase small  30.65 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  42.39 
 
 		 255 aa  61.6  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.19 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1586  ribosomal L11 methyltransferase  46.88 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.472869  normal  0.567959 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  31.63 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.68 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0543  bifunctional methyltransferase  35.87 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.68 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.87 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.53 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.25 
 
 		 391 aa  58.5  0.00000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.82 
 
 		 300 aa  58.2  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  41.46 
 
 		 262 aa  58.2  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  54.9 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.68 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.68 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  36.08 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  54.9 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.45 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.42 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.68 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.86 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.77 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2861  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  39.39 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0308666  decreased coverage  0.000000000135895 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  59.18 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  58 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2066  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.65 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.05 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2779  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.86 
 
 		 313 aa  55.5  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.159929  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.7 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0952  hypothetical protein  34.38 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0886021  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.5 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2071  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  41.77 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000425101  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.38 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00359705  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1435  ribosomal L11 methyltransferase  40.28 
 
 		 276 aa  53.9  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.35 
 
 		 295 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.75 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4030  protein of unknown function Met10  40.51 
 
 		 552 aa  54.3  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.33 
 
 		 294 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.47 
 
 		 293 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  29.29 
 
 		 310 aa  53.9  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  45.45 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1523  cobalt-precorrin-6Y C(15)-methyltransferase  54 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132961 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.59 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2057  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.51 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00373445  unclonable  0.00000000000181282 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2983  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.33 
 
 		 296 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.599101  normal  0.251528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  42.86 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.38 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.67 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2405  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.51 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0031453  unclonable  0.0000107222 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0187  ribosomal L11 methyltransferase  47.89 
 
 		 258 aa  53.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2061  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.51 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000216259  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2288  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.51 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434685  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1730  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.48 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.5 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  41.27 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.68 
 
 		 247 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.13 
 
 		 259 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  41.27 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  39.39 
 
 		 334 aa  52.4  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  39.29 
 
 		 278 aa  52.8  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  37.5 
 
 		 287 aa  52.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  63.41 
 
 		 316 aa  52.4  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.47 
 
 		 293 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  26.85 
 
 		 297 aa  52.4  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 		 300 aa  52  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00659  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- benzoquinol methylase  38.6 
 
 		 250 aa  52.4  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1430  modification methylase, HemK family  38.27 
 
 		 273 aa  52  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000467016  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  35 
 
 		 281 aa  52.4  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  41.27 
 
 		 232 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  41.27 
 
 		 232 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1918  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  42.42 
 
 		 236 aa  52  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00158805  hitchhiker  0.0000000749006 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  38.16 
 
 		 250 aa  52  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>