More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2083 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2083  methyltransferase small  100 
 
 
204 aa  418  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1845  methyltransferase small  59.61 
 
 
203 aa  246  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2614  methyltransferase small  55.45 
 
 
202 aa  223  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  53.47 
 
 
200 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2169  methyltransferase small  54.68 
 
 
202 aa  221  7e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1437  methyltransferase  47.09 
 
 
203 aa  169  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1635  methyltransferase  46.5 
 
 
197 aa  168  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0006  methyltransferase small  42.64 
 
 
209 aa  157  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2486  putative RNA methylase  40.32 
 
 
207 aa  144  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1507  methyltransferase small  37.74 
 
 
207 aa  140  9e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.113673  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0317  DNA methylase  34.04 
 
 
230 aa  138  7e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0651  methyltransferase related protein  34.98 
 
 
201 aa  135  5e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0529  methyltransferase small  39.51 
 
 
211 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3583  Methyltransferase type 11  41.46 
 
 
215 aa  132  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1798  hypothetical protein  39.35 
 
 
219 aa  132  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0202  methyltransferase small  34.6 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0891  methyltransferase  34.12 
 
 
213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1709  SAM-binding motif-containing protein  34.12 
 
 
213 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1492  methyltransferase small  39.32 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0731  methyltransferase  33.51 
 
 
192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.557885  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0520  methyltransferase small  34.02 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2885  Methyltransferase type 11  30.24 
 
 
202 aa  111  8.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0236  methyltransferase  34.72 
 
 
202 aa  101  8e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.140784 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0747  methyltransferase small  36.5 
 
 
202 aa  97.4  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2199  methyltransferase small  34.63 
 
 
204 aa  91.3  9e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0577  putative RNA methylase  31.31 
 
 
209 aa  89.4  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0475078  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89455  predicted protein  32.55 
 
 
273 aa  87  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0270328  hitchhiker  0.00142671 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1027  methyltransferase small  33.67 
 
 
202 aa  71.2  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.653498  normal  0.0217295 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.23 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  27.38 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  36 
 
 
264 aa  61.6  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  37.33 
 
 
264 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.25 
 
 
293 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  44 
 
 
293 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  44 
 
 
293 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  44 
 
 
293 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.08 
 
 
293 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  27.11 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0852  hypothetical protein  37.76 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0331  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.06 
 
 
293 aa  59.3  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  44 
 
 
293 aa  59.7  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  44 
 
 
293 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  44 
 
 
293 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.86 
 
 
295 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.86 
 
 
295 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.67 
 
 
293 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  35.54 
 
 
275 aa  58.9  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.23 
 
 
293 aa  58.5  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0952  hypothetical protein  34.94 
 
 
196 aa  58.2  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0886021  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  32.97 
 
 
202 aa  58.2  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.26 
 
 
295 aa  58.2  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0391  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.15 
 
 
293 aa  58.2  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000998179  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.67 
 
 
293 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0527  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.57 
 
 
289 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0503  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.8 
 
 
289 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2983  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.44 
 
 
296 aa  57.4  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.599101  normal  0.251528 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  28.46 
 
 
276 aa  57  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1441  methyltransferase  34.57 
 
 
175 aa  57  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  26.86 
 
 
310 aa  57  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.26 
 
 
295 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  43.66 
 
 
318 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0023  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  43.24 
 
 
295 aa  57  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.06 
 
 
293 aa  56.6  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1395  putative methyltransferase  34.57 
 
 
175 aa  57  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.96 
 
 
293 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  39.18 
 
 
231 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.67 
 
 
293 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0187  ribosomal L11 methyltransferase  33.68 
 
 
258 aa  56.6  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2244  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.54 
 
 
293 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.924831  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36 
 
 
293 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.89 
 
 
300 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  42.05 
 
 
196 aa  55.5  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.96 
 
 
293 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.96 
 
 
293 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.96 
 
 
306 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  28.43 
 
 
287 aa  55.5  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0455  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.92 
 
 
293 aa  55.5  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  33.33 
 
 
202 aa  55.5  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3613  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.38 
 
 
325 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.283182  normal  0.0446464 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1761  oxidoreductase  31.09 
 
 
389 aa  55.1  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1828  hypothetical protein  31.09 
 
 
389 aa  55.1  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.929329  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.98 
 
 
295 aa  55.1  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  40 
 
 
311 aa  55.1  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.44 
 
 
328 aa  54.7  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.93 
 
 
300 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  27.54 
 
 
208 aa  54.7  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.08 
 
 
300 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.08 
 
 
300 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.08 
 
 
300 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  41.33 
 
 
258 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  38.82 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.08 
 
 
300 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.78 
 
 
300 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  38 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4852  putative methylase  38.82 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  34.41 
 
 
413 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.23 
 
 
294 aa  54.3  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.93 
 
 
300 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.93 
 
 
302 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4941  putative methylase  38.82 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485322  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>