194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0202 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0202  methyltransferase small  100 
 
 
213 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0891  methyltransferase  94.37 
 
 
213 aa  406  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1709  SAM-binding motif-containing protein  93.43 
 
 
213 aa  402  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1507  methyltransferase small  71.23 
 
 
207 aa  315  4e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.113673  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0317  DNA methylase  59.39 
 
 
230 aa  275  5e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0006  methyltransferase small  39.91 
 
 
209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0651  methyltransferase related protein  38.14 
 
 
201 aa  143  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2083  methyltransferase small  34.6 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2169  methyltransferase small  37.33 
 
 
202 aa  128  6e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1437  methyltransferase  36.95 
 
 
203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2486  putative RNA methylase  31.31 
 
 
207 aa  124  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0520  methyltransferase small  34.4 
 
 
210 aa  124  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  35.51 
 
 
200 aa  123  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1635  methyltransferase  39.25 
 
 
197 aa  122  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2614  methyltransferase small  35.98 
 
 
202 aa  122  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1845  methyltransferase small  33.95 
 
 
203 aa  121  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2885  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 
202 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1798  hypothetical protein  31.92 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0731  methyltransferase  31.71 
 
 
192 aa  115  6e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.557885  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0529  methyltransferase small  29.3 
 
 
211 aa  112  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1492  methyltransferase small  31.16 
 
 
207 aa  109  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89455  predicted protein  33.03 
 
 
273 aa  102  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0270328  hitchhiker  0.00142671 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3583  Methyltransferase type 11  30.52 
 
 
215 aa  100  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0236  methyltransferase  30.7 
 
 
202 aa  99  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.140784 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0577  putative RNA methylase  31.46 
 
 
209 aa  94.7  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0475078  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2199  methyltransferase small  31.25 
 
 
204 aa  94  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0747  methyltransferase small  31.19 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1027  methyltransferase small  29.13 
 
 
202 aa  64.7  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.653498  normal  0.0217295 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.59 
 
 
295 aa  58.9  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  43.14 
 
 
264 aa  55.1  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  43.14 
 
 
264 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.78 
 
 
295 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.78 
 
 
295 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.56 
 
 
295 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  47.92 
 
 
299 aa  52.8  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.86 
 
 
306 aa  52  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.86 
 
 
293 aa  51.6  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.86 
 
 
293 aa  51.6  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.86 
 
 
293 aa  51.6  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.44 
 
 
300 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.89 
 
 
295 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_6437  predicted protein  50 
 
 
297 aa  50.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000205122  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.56 
 
 
294 aa  50.1  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2010  methyltransferase small  36.61 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.76 
 
 
300 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  40.26 
 
 
208 aa  50.1  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.86 
 
 
300 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.67 
 
 
296 aa  49.3  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.38 
 
 
300 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.38 
 
 
300 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.38 
 
 
300 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.38 
 
 
300 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.38 
 
 
300 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.11 
 
 
295 aa  48.9  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.32 
 
 
300 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.32 
 
 
300 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.76 
 
 
300 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  61.54 
 
 
296 aa  48.5  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.47 
 
 
293 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.47 
 
 
293 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.47 
 
 
293 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  42.11 
 
 
311 aa  48.5  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.32 
 
 
300 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.32 
 
 
300 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.32 
 
 
300 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.32 
 
 
300 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  29.57 
 
 
210 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.094641 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 
304 aa  48.1  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.71 
 
 
302 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  35 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  35 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  34.83 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  35 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  35 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.92 
 
 
315 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0331  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.86 
 
 
293 aa  47.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  40.74 
 
 
251 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.16 
 
 
293 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  34.75 
 
 
232 aa  46.6  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  40 
 
 
294 aa  47  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03000  ribosomal protein L11 methyltransferase  44 
 
 
301 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0391  ribosomal protein L11 methyltransferase  56.41 
 
 
293 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000998179  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  32.26 
 
 
360 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.11 
 
 
313 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.11 
 
 
295 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.38 
 
 
300 aa  46.2  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0810  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.86 
 
 
292 aa  46.6  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0784  ribosomal L11 methyltransferase  41.67 
 
 
287 aa  46.6  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.59 
 
 
300 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  33.75 
 
 
251 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0023  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  41.82 
 
 
295 aa  45.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.84 
 
 
293 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.84 
 
 
293 aa  46.2  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0187  ribosomal L11 methyltransferase  41.43 
 
 
258 aa  46.2  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.84 
 
 
293 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.84 
 
 
293 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1649  methyltransferase small  34.78 
 
 
223 aa  45.8  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.84 
 
 
293 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2983  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.71 
 
 
296 aa  45.8  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.599101  normal  0.251528 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0527  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.43 
 
 
289 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>