More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2010 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2010  methyltransferase small  100 
 
 
199 aa  395  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0188  methyltransferase small  55.5 
 
 
196 aa  226  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3378  methyltransferase small  53.06 
 
 
207 aa  211  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.480246  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0056  methyltransferase small  33.33 
 
 
202 aa  98.2  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.612359  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0578  hypothetical protein  30 
 
 
202 aa  95.5  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00141674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0564  hypothetical protein  30 
 
 
202 aa  95.5  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000796636  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  36.99 
 
 
198 aa  94.4  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  30.56 
 
 
202 aa  94  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0365  16S RNA G1207 methylase RsmC  30.6 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000491167 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0055  methyltransferase small  33.92 
 
 
202 aa  91.7  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  33.53 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  35.12 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0952  hypothetical protein  35.09 
 
 
196 aa  89  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0886021  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  32.76 
 
 
200 aa  88.6  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0079  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.61 
 
 
343 aa  88.2  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2367  methyltransferase small  31.18 
 
 
205 aa  87.8  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.709959  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0047  hypothetical protein  31.89 
 
 
202 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.23937  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0102  methyltransferase small  31.98 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  30.39 
 
 
196 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0098  methyltransferase small  29.07 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  32.58 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0852  hypothetical protein  34.5 
 
 
196 aa  85.5  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2178  methyltransferase small  29.17 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  32.94 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  26.52 
 
 
199 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2883  methyltransferase small  33.33 
 
 
195 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0213  methyltransferase small  35.62 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3620  methyltransferase small  34.48 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000543036  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5204  ybxB protein  28.65 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000704133  unclonable  8.56715e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0122  ybxB protein  28.65 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0112  ybxB protein  28.07 
 
 
199 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.23527e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0097  methyltransferase  28.07 
 
 
199 aa  79  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00285716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0101  ybxB protein  28.07 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0101  ybxB protein  28.07 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0743942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0101  methyltransferase  28.07 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00115806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0132  ybxB protein  28.07 
 
 
199 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0095  methyltransferase  28.07 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00417025  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0957  methyltransferase small  31.98 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0803  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  25.84 
 
 
332 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0751  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  30.06 
 
 
377 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4648  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  26.86 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4427  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  26.82 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3099  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.98 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4510  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.43 
 
 
374 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0649  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  25.65 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0761  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  25 
 
 
332 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0789  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  25 
 
 
332 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1368  methyltransferase small  35.92 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41240  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  25.14 
 
 
333 aa  75.5  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0354958  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0569  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.39 
 
 
320 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5273  hypothetical protein  24.42 
 
 
332 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03421  16S rRNA m2G 1207 methyltransferase  29.88 
 
 
341 aa  74.7  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0540  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.93 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3753  methyltransferase small  28.36 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0210542  unclonable  0.0000136364 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2720  methyltransferase small  25.14 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.269634  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4642  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  26.7 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458952  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0790  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  26.7 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.960699  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0095  methyltransferase small  30.41 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000227182  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2296  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  26.92 
 
 
382 aa  72.8  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0838  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.21 
 
 
347 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0831  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.21 
 
 
347 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000982153 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0806  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.21 
 
 
347 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3530  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.21 
 
 
347 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4494  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  25.14 
 
 
357 aa  72  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187247  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03670  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  27.65 
 
 
410 aa  72  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0058  methyltransferase small  31.79 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.505565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1146  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  26.67 
 
 
332 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0986  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  25.7 
 
 
332 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1130  methyltransferase small  35.85 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.157552  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0500  methyltransferase family protein  25.56 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5261  hypothetical protein  28.09 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1094  methyltransferase family protein  25.56 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3540  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.22 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61090  hypothetical protein  28.25 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1532  16S RNA G1207 methylase RsmC  26.11 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0496562  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  41.49 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2548  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.65 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0562  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  25.56 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002588  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  29.27 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.328376  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3164  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.94 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.908437  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3230  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.88 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3266  methyltransferase family protein  26.99 
 
 
378 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2559  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.75 
 
 
333 aa  68.9  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  43.59 
 
 
341 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4398  methyltransferase family protein  26.99 
 
 
378 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3551  methyltransferase family protein  26.99 
 
 
378 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.715445  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3107  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.66 
 
 
424 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02953  predicted methyltransferase small domain protein  26.99 
 
 
378 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.932985  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0617  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  26.99 
 
 
378 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1943  methyltransferase small  25.75 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.062516  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3679  methyltransferase small  31.39 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110795  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0616  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  26.99 
 
 
378 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3376  methyltransferase family protein  26.99 
 
 
378 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3447  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  30.57 
 
 
353 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00223061 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02903  hypothetical protein  26.99 
 
 
378 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781708  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3032  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.4 
 
 
349 aa  68.6  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4712  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  25.56 
 
 
332 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0865771  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0613  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  25.71 
 
 
348 aa  68.2  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2977  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.48 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2886  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  25.88 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>