More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1845 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1845  methyltransferase small  100 
 
 		 203 aa  409  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2083  methyltransferase small  59.61 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  56.16 
 
 		 200 aa  224  7e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2169  methyltransferase small  55.39 
 
 		 202 aa  208  5e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2614  methyltransferase small  51.94 
 
 		 202 aa  198  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1437  methyltransferase  49.74 
 
 		 203 aa  179  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0006  methyltransferase small  46.77 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1635  methyltransferase  45.7 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0529  methyltransferase small  41.55 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2486  putative RNA methylase  40 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1507  methyltransferase small  34.93 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.113673  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1798  hypothetical protein  39.91 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0651  methyltransferase related protein  33.82 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0317  DNA methylase  30.74 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3583  Methyltransferase type 11  41.51 
 
 		 215 aa  124  8.000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1709  SAM-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0202  methyltransferase small  33.95 
 
 		 213 aa  121  6e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0891  methyltransferase  32.41 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1492  methyltransferase small  36.82 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0520  methyltransferase small  39.32 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0577  putative RNA methylase  36.95 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0475078  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0236  methyltransferase  35.82 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.140784 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89455  predicted protein  35.84 
 
 		 273 aa  95.9  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0270328  hitchhiker  0.00142671 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0731  methyltransferase  34.25 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.557885  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2885  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2199  methyltransferase small  36.84 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0747  methyltransferase small  36.51 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.93 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1027  methyltransferase small  37.57 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.653498  normal  0.0217295 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.75 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.16 
 
 		 295 aa  61.2  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.16 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.45 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.59 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.16 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4030  protein of unknown function Met10  41.77 
 
 		 552 aa  60.1  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.26 
 
 		 506 aa  60.1  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.67 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.16 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.16 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  38.64 
 
 		 390 aa  58.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1586  ribosomal L11 methyltransferase  49.35 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.472869  normal  0.567959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.69 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.16 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.75 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.86 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2938  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.56 
 
 		 293 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.56 
 
 		 293 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.56 
 
 		 306 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0187  ribosomal L11 methyltransferase  42.31 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.86 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  34.21 
 
 		 460 aa  56.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  34.34 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03000  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.15 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  61.9 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  46.55 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.93 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.42 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.61 
 
 		 328 aa  55.1  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  46.55 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03498  oxidoreductase  42.68 
 
 		 364 aa  54.7  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.906105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.48 
 
 		 302 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  44.74 
 
 		 288 aa  54.7  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.48 
 
 		 300 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3743  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.45 
 
 		 293 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.324261  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0194  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.09 
 
 		 292 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0331  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.18 
 
 		 293 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.93 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.92 
 
 		 296 aa  53.9  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.93 
 
 		 300 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 392 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.93 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.48 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  51.79 
 
 		 299 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3575  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.45 
 
 		 293 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.12838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.3 
 
 		 293 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.48 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.48 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3646  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.45 
 
 		 293 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.135295  decreased coverage  0.000138763 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3681  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.45 
 
 		 293 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.463059  normal  0.132587 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3574  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.45 
 
 		 293 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00265065  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.48 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.48 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0373  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.09 
 
 		 292 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0981448 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  44.64 
 
 		 311 aa  54.3  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.93 
 
 		 300 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.06 
 
 		 293 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1998  ribosomal L11 methyltransferase  44.16 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.831895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.93 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.93 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.48 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  30.82 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  56.52 
 
 		 293 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.48 
 
 		 300 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  53.7 
 
 		 307 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_18872  magnesium-protoporphyrin IX methyltransferase  35.56 
 
 		 258 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333886  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  61.9 
 
 		 316 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2947  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.29 
 
 		 297 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>