More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6903 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  100 
 
 		 390 aa  808    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  55.9 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  52.32 
 
 		 391 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  52.32 
 
 		 391 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  54.36 
 
 		 418 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  53.35 
 
 		 395 aa  429  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  51.93 
 
 		 389 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  51.8 
 
 		 400 aa  408  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  51.79 
 
 		 394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  51.02 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  46.41 
 
 		 391 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  45.64 
 
 		 392 aa  346  3e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  46.46 
 
 		 413 aa  342  7e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  43.24 
 
 		 416 aa  334  2e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  42.39 
 
 		 409 aa  322  6e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  41.81 
 
 		 396 aa  318  9e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1889  hypothetical protein  41.94 
 
 		 388 aa  317  2e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  41.56 
 
 		 396 aa  316  4e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  41.39 
 
 		 396 aa  316  5e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  41.56 
 
 		 396 aa  316  6e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  44.47 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  39.74 
 
 		 392 aa  311  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  40.91 
 
 		 396 aa  306  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  41.75 
 
 		 397 aa  306  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  42.42 
 
 		 393 aa  305  6e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  40.98 
 
 		 393 aa  305  8.000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  39.9 
 
 		 395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  43.37 
 
 		 391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  41.9 
 
 		 394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  38.05 
 
 		 439 aa  301  1e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  41.04 
 
 		 396 aa  300  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  43.11 
 
 		 391 aa  300  3e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  41.12 
 
 		 396 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  41.06 
 
 		 411 aa  299  5e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  42.2 
 
 		 393 aa  297  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  40.86 
 
 		 396 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  40.86 
 
 		 396 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  40.86 
 
 		 396 aa  297  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  40.86 
 
 		 396 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  41.24 
 
 		 394 aa  296  4e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  39.6 
 
 		 404 aa  295  7e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  40.3 
 
 		 397 aa  295  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  40.91 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  42.42 
 
 		 393 aa  292  6e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  39.36 
 
 		 404 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  39.11 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  38.3 
 
 		 422 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  39.36 
 
 		 404 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  39.11 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  39.11 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  39.11 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  38.03 
 
 		 425 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  37.91 
 
 		 396 aa  289  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  39.8 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  39.2 
 
 		 397 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  37.97 
 
 		 423 aa  285  9e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  40.72 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  39.25 
 
 		 400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  38.79 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  39.1 
 
 		 400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  37.56 
 
 		 396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  37.56 
 
 		 396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  38.75 
 
 		 400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  38.14 
 
 		 396 aa  282  6.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  38.6 
 
 		 400 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  40.7 
 
 		 397 aa  282  9e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  37.56 
 
 		 396 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  37.56 
 
 		 396 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  38.07 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  37.85 
 
 		 391 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  37.91 
 
 		 403 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  37.91 
 
 		 403 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  37.91 
 
 		 403 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  37.91 
 
 		 403 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  37.91 
 
 		 403 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  37.31 
 
 		 396 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  37.56 
 
 		 425 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  37.56 
 
 		 425 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  37.56 
 
 		 425 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  39.39 
 
 		 396 aa  280  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  37.56 
 
 		 425 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  37.56 
 
 		 425 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  37.47 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  37.06 
 
 		 396 aa  277  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  39.95 
 
 		 397 aa  276  7e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  39.19 
 
 		 396 aa  275  8e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  36.96 
 
 		 398 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  36.04 
 
 		 396 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  36.04 
 
 		 396 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  36.34 
 
 		 396 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  37.53 
 
 		 396 aa  272  7e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  38.82 
 
 		 391 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  41.18 
 
 		 389 aa  269  5e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2702  putative SAM-dependent methyltransferase  38.32 
 
 		 408 aa  266  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  36.22 
 
 		 390 aa  265  8e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3058  PUA domain containing protein  38.96 
 
 		 400 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  37.66 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  38.19 
 
 		 418 aa  263  4e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  38.5 
 
 		 394 aa  262  6e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  37.87 
 
 		 367 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>