More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1865 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  786    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  46.56 
 
 		 418 aa  338  7e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  45.13 
 
 		 392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  42.2 
 
 		 389 aa  335  9e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  47.94 
 
 		 392 aa  333  4e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  43.93 
 
 		 395 aa  333  4e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  42.86 
 
 		 415 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  49.22 
 
 		 397 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  47.3 
 
 		 396 aa  323  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  45.04 
 
 		 391 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  42.35 
 
 		 394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  42.35 
 
 		 393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  40.56 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  41.67 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  42.86 
 
 		 394 aa  292  6e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  41.18 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  42.35 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  39.33 
 
 		 391 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  41.33 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  39.33 
 
 		 391 aa  289  7e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  42.24 
 
 		 413 aa  288  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  39.54 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  38.99 
 
 		 394 aa  287  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  38.58 
 
 		 398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0614  SAM-dependent methyltransferase  41.16 
 
 		 396 aa  280  5e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  40.92 
 
 		 399 aa  278  8e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  41.84 
 
 		 393 aa  277  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  43.13 
 
 		 426 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2702  putative SAM-dependent methyltransferase  40.71 
 
 		 408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  42.04 
 
 		 396 aa  272  6e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  41.78 
 
 		 396 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  39.56 
 
 		 416 aa  267  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  38.42 
 
 		 394 aa  267  2.9999999999999995e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  41.78 
 
 		 396 aa  266  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  39.38 
 
 		 391 aa  266  5e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  38.43 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  41.51 
 
 		 396 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  39.14 
 
 		 400 aa  265  8.999999999999999e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  39.69 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  39.12 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  40.41 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  39.42 
 
 		 398 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  39.15 
 
 		 398 aa  262  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  41.51 
 
 		 396 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  40.93 
 
 		 411 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  41.51 
 
 		 396 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  41.51 
 
 		 396 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  41.51 
 
 		 396 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  38.1 
 
 		 409 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3451  SAM-dependent methyltransferase  39.8 
 
 		 396 aa  260  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  39.9 
 
 		 396 aa  260  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0366  SAM-dependent methyltransferase  41.27 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0859295  normal  0.454449 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  41.25 
 
 		 396 aa  259  4e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  42.2 
 
 		 391 aa  259  4e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  39.74 
 
 		 396 aa  258  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  39.74 
 
 		 396 aa  258  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  38.36 
 
 		 397 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1889  hypothetical protein  35.82 
 
 		 388 aa  256  4e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  39.74 
 
 		 396 aa  256  4e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  40.99 
 
 		 396 aa  256  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  39.22 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  39.22 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  38.96 
 
 		 396 aa  253  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  39.06 
 
 		 391 aa  252  6e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  41.04 
 
 		 397 aa  252  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  38.7 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  37.83 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  36.18 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3779  protein of unknown function Met10  40.79 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  37.57 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  38.24 
 
 		 394 aa  250  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  38.18 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  36.5 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3722  SAM-dependent methyltransferase  40.53 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  37.57 
 
 		 398 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  38.18 
 
 		 403 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  38.18 
 
 		 403 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  37.83 
 
 		 398 aa  249  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  38.18 
 
 		 403 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  39.49 
 
 		 407 aa  249  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  38.18 
 
 		 403 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1714  protein of unknown function Met10  40.1 
 
 		 404 aa  249  8e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  38.18 
 
 		 403 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  37.3 
 
 		 398 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  35.62 
 
 		 397 aa  248  9e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  37.3 
 
 		 398 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3750  hypothetical protein  36.18 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0864598 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3862  protein of unknown function Met10  40.53 
 
 		 389 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  37.66 
 
 		 396 aa  248  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  37.66 
 
 		 396 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  37.66 
 
 		 396 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  36.27 
 
 		 418 aa  248  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  39.74 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  39.23 
 
 		 407 aa  246  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2043  protein of unknown function Met10  40.56 
 
 		 402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338836  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  39.85 
 
 		 396 aa  246  6e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  36.77 
 
 		 399 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  37.57 
 
 		 398 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  35.97 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2446  hypothetical protein  41.77 
 
 		 398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.920431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>