More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0993 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  100 
 
 		 391 aa  797    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  95.65 
 
 		 391 aa  768    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  59.28 
 
 		 394 aa  455  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1889  hypothetical protein  55.67 
 
 		 388 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  45.52 
 
 		 415 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  47.96 
 
 		 395 aa  353  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  46.89 
 
 		 392 aa  350  2e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  45.64 
 
 		 389 aa  348  8e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  43.8 
 
 		 394 aa  326  5e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  43.54 
 
 		 394 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  42.09 
 
 		 391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  42.57 
 
 		 409 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  41.84 
 
 		 391 aa  309  5e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  43.83 
 
 		 397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  42.17 
 
 		 413 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  41.94 
 
 		 418 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  43.37 
 
 		 390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  41.86 
 
 		 397 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  40.68 
 
 		 396 aa  293  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  39.39 
 
 		 391 aa  292  8e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  39.43 
 
 		 397 aa  289  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  39.05 
 
 		 396 aa  288  8e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  39.07 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  39.43 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  39.59 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  39.03 
 
 		 400 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  39.42 
 
 		 394 aa  280  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  38.52 
 
 		 400 aa  278  9e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  38.76 
 
 		 394 aa  278  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  39.74 
 
 		 400 aa  277  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  38.79 
 
 		 404 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  37.73 
 
 		 396 aa  276  4e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  41.71 
 
 		 400 aa  276  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  38.79 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  38.79 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  38.5 
 
 		 396 aa  276  5e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  38.79 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  38.5 
 
 		 396 aa  276  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  38.79 
 
 		 404 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  36.83 
 
 		 439 aa  275  7e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  38.38 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  38.79 
 
 		 404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  38.14 
 
 		 400 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  38.24 
 
 		 396 aa  273  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  38.93 
 
 		 394 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  38.92 
 
 		 418 aa  273  6e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  37.76 
 
 		 400 aa  272  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  36.87 
 
 		 422 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  37.08 
 
 		 425 aa  272  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  37.89 
 
 		 400 aa  272  9e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  38.1 
 
 		 416 aa  271  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  37.98 
 
 		 396 aa  272  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  38.14 
 
 		 400 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  36.78 
 
 		 423 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  35.97 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  38.01 
 
 		 400 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  37.63 
 
 		 411 aa  269  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  38.68 
 
 		 393 aa  270  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  38.14 
 
 		 397 aa  269  7e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  38.14 
 
 		 397 aa  268  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4768  SAM-dependent methyltransferase  39.07 
 
 		 405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000059274  normal  0.0101611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3058  PUA domain containing protein  39.74 
 
 		 400 aa  266  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  35.49 
 
 		 395 aa  266  5e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4090  PUA domain-containing protein  39.14 
 
 		 396 aa  266  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.337957  normal  0.372554 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  37.91 
 
 		 393 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  38.1 
 
 		 391 aa  265  7e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  38.44 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  38.75 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  36.6 
 
 		 425 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  38.38 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  36.69 
 
 		 396 aa  263  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  36.6 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  36.6 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  36.6 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  36.6 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  35.37 
 
 		 396 aa  263  6e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  34.86 
 
 		 396 aa  262  8e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  34.86 
 
 		 396 aa  262  8e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2323  methyltransferase small  39.07 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.475171  hitchhiker  0.00560103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  36.34 
 
 		 397 aa  262  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  34.86 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  34.86 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  34.86 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  37.01 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  38.38 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  34.86 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  37.01 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  37.01 
 
 		 396 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  37.01 
 
 		 396 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  37.01 
 
 		 396 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  36.77 
 
 		 388 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  35.43 
 
 		 392 aa  259  8e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3779  protein of unknown function Met10  38.1 
 
 		 389 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3862  protein of unknown function Met10  38.1 
 
 		 389 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  37.14 
 
 		 394 aa  255  7e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1086  methyltransferase small  40.21 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  36.15 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  33.59 
 
 		 396 aa  253  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  34.11 
 
 		 403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  34.11 
 
 		 403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>