More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4768 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4768  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
405 aa  841    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000059274  normal  0.0101611 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  45.57 
 
 
388 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3779  protein of unknown function Met10  46.45 
 
 
389 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3862  protein of unknown function Met10  46.19 
 
 
389 aa  319  6e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3722  SAM-dependent methyltransferase  45.94 
 
 
389 aa  318  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  43.44 
 
 
395 aa  301  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  43.77 
 
 
391 aa  295  7e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  40.46 
 
 
415 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1446  hypothetical protein  43.5 
 
 
390 aa  290  4e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.721087  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  39.95 
 
 
418 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  42.21 
 
 
392 aa  285  8e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0954  SAM-dependent methyltransferase  41.67 
 
 
384 aa  281  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  38.79 
 
 
389 aa  280  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  40.36 
 
 
391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  37.37 
 
 
391 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  39.07 
 
 
391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  37.09 
 
 
394 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  37.34 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  37.69 
 
 
394 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  37.21 
 
 
394 aa  252  9.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2702  putative SAM-dependent methyltransferase  38.5 
 
 
408 aa  252  9.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  36.87 
 
 
392 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  37.14 
 
 
391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  37.14 
 
 
391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  37.76 
 
 
394 aa  241  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  37.81 
 
 
413 aa  241  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  39.33 
 
 
397 aa  239  9e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  36.11 
 
 
393 aa  237  3e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  38.9 
 
 
416 aa  236  8e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  35.97 
 
 
393 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  35.97 
 
 
393 aa  232  7.000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  36.79 
 
 
397 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  36.61 
 
 
409 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1889  hypothetical protein  32.83 
 
 
388 aa  231  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  35.86 
 
 
393 aa  230  4e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  38.07 
 
 
404 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  34.5 
 
 
400 aa  229  8e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  36.02 
 
 
397 aa  229  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  38.07 
 
 
404 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  37.82 
 
 
404 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  35.49 
 
 
396 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  34.76 
 
 
398 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  35.53 
 
 
394 aa  224  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  34.52 
 
 
394 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  37.05 
 
 
397 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  34.75 
 
 
396 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  37.31 
 
 
404 aa  223  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  36.87 
 
 
404 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  36.87 
 
 
404 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  36.87 
 
 
404 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  34.5 
 
 
396 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  36.89 
 
 
422 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  37.02 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  38.65 
 
 
389 aa  220  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  31.85 
 
 
397 aa  219  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  34.5 
 
 
396 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  34.5 
 
 
396 aa  219  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  36.21 
 
 
425 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  36.43 
 
 
394 aa  219  7.999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  36.8 
 
 
423 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  35.97 
 
 
425 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  35.97 
 
 
425 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  35.97 
 
 
425 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  35.97 
 
 
425 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  34.75 
 
 
396 aa  216  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  35.97 
 
 
425 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  34.77 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  33.42 
 
 
397 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  34.79 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  31.87 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  31.87 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  31.61 
 
 
396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  35.79 
 
 
393 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  31.02 
 
 
397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  36.41 
 
 
396 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  34.4 
 
 
390 aa  210  3e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  32.82 
 
 
396 aa  210  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2179  methyltransferase small  35.95 
 
 
393 aa  210  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.41478  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  35.48 
 
 
400 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  33.25 
 
 
411 aa  209  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  33.41 
 
 
439 aa  209  6e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  34.09 
 
 
396 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  31.35 
 
 
396 aa  208  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  30.98 
 
 
418 aa  207  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  34.09 
 
 
396 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  34.09 
 
 
396 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  34.09 
 
 
396 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  32.3 
 
 
396 aa  207  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  33.83 
 
 
396 aa  206  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  31.52 
 
 
391 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  31.52 
 
 
396 aa  205  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  31.52 
 
 
396 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2323  methyltransferase small  39.19 
 
 
400 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.475171  hitchhiker  0.00560103 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  36.67 
 
 
400 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  35.09 
 
 
397 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  36.88 
 
 
400 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  30.75 
 
 
403 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  30.75 
 
 
403 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  30.75 
 
 
403 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  30.75 
 
 
403 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>