More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0981 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
393 aa  815    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  73.72 
 
 
393 aa  615  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  73.98 
 
 
393 aa  600  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  71.68 
 
 
393 aa  596  1e-169  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  69.39 
 
 
393 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  64.89 
 
 
394 aa  552  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  63.87 
 
 
394 aa  525  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  43.44 
 
 
395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  42.16 
 
 
392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  42.39 
 
 
391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  42.01 
 
 
396 aa  309  5e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  42.42 
 
 
390 aa  305  6e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  41.22 
 
 
418 aa  305  6e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  40.83 
 
 
415 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  39.85 
 
 
390 aa  298  1e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  40.26 
 
 
389 aa  298  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  40.66 
 
 
392 aa  291  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  39.29 
 
 
398 aa  290  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  40.98 
 
 
397 aa  290  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  39.59 
 
 
391 aa  287  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  39.59 
 
 
391 aa  288  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  39.8 
 
 
400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  39.19 
 
 
394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  42.16 
 
 
400 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  40.05 
 
 
407 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  38.93 
 
 
394 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  40.56 
 
 
389 aa  280  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  39.79 
 
 
407 aa  279  7e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  38.13 
 
 
413 aa  272  9e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  38.93 
 
 
391 aa  271  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3451  SAM-dependent methyltransferase  38.72 
 
 
396 aa  270  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  35.64 
 
 
394 aa  270  4e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  38.68 
 
 
391 aa  270  5e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  37.16 
 
 
416 aa  268  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  39.38 
 
 
396 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  39.64 
 
 
396 aa  267  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0812  hypothetical protein  37.44 
 
 
398 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.199944  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  39.12 
 
 
396 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0366  SAM-dependent methyltransferase  38.78 
 
 
403 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0859295  normal  0.454449 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  38.89 
 
 
391 aa  266  5.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  38.08 
 
 
400 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  38.07 
 
 
397 aa  264  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  36.15 
 
 
396 aa  264  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  37.82 
 
 
400 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1889  hypothetical protein  35.77 
 
 
388 aa  265  2e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  37.66 
 
 
409 aa  264  3e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2702  putative SAM-dependent methyltransferase  37.69 
 
 
408 aa  263  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  37.37 
 
 
394 aa  264  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  35.9 
 
 
396 aa  262  6e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  35.64 
 
 
396 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  35.64 
 
 
396 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  37.82 
 
 
400 aa  262  8e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  38.7 
 
 
396 aa  262  8e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  39.12 
 
 
396 aa  261  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  35.64 
 
 
396 aa  261  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  35.82 
 
 
391 aa  260  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  35.64 
 
 
396 aa  260  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  35.64 
 
 
396 aa  260  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  37.34 
 
 
397 aa  259  7e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3750  hypothetical protein  36.96 
 
 
398 aa  259  8e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0864598 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1714  protein of unknown function Met10  38.85 
 
 
404 aa  259  8e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0614  SAM-dependent methyltransferase  34.85 
 
 
396 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  37.15 
 
 
397 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  38.7 
 
 
396 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  38.7 
 
 
396 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  38.7 
 
 
396 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  36.55 
 
 
399 aa  256  5e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  36.15 
 
 
394 aa  256  6e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  35.64 
 
 
403 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  38.7 
 
 
396 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  35.64 
 
 
403 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  38.7 
 
 
396 aa  255  8e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  35.64 
 
 
403 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  35.64 
 
 
403 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  35.64 
 
 
403 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  36.83 
 
 
397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3333  SAM-dependent methyltransferase  38.3 
 
 
416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  35.64 
 
 
396 aa  253  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  36.15 
 
 
398 aa  252  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  36.29 
 
 
408 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  37.98 
 
 
397 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  37.06 
 
 
418 aa  252  9.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3779  protein of unknown function Met10  36.41 
 
 
389 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  36.15 
 
 
398 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0954  SAM-dependent methyltransferase  38.02 
 
 
384 aa  250  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  34.62 
 
 
396 aa  249  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  34.62 
 
 
396 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3862  protein of unknown function Met10  36.73 
 
 
389 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  35.38 
 
 
398 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  34.62 
 
 
396 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  35.38 
 
 
399 aa  249  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  34.36 
 
 
397 aa  249  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  36.15 
 
 
398 aa  249  6e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  34.79 
 
 
388 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  35.38 
 
 
398 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  36.15 
 
 
398 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  35.13 
 
 
398 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  35.58 
 
 
395 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  36.79 
 
 
411 aa  248  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  36.96 
 
 
397 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>