More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0845 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
397 aa  806    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  75.83 
 
 
396 aa  622  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  66.58 
 
 
391 aa  536  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  56.96 
 
 
392 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  49.1 
 
 
418 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  50.39 
 
 
392 aa  371  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  47.18 
 
 
415 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  46.39 
 
 
395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  42.44 
 
 
409 aa  335  7.999999999999999e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  42.05 
 
 
389 aa  334  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  43.72 
 
 
394 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  44.09 
 
 
391 aa  323  3e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  43.77 
 
 
413 aa  323  5e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  42.67 
 
 
394 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  43.83 
 
 
391 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  49.22 
 
 
389 aa  321  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  41.75 
 
 
390 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  43.11 
 
 
390 aa  318  9e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  40.31 
 
 
391 aa  317  3e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  40.31 
 
 
391 aa  315  7e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  42.46 
 
 
400 aa  312  5.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0614  SAM-dependent methyltransferase  44.08 
 
 
396 aa  310  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  43.44 
 
 
396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  45.36 
 
 
391 aa  305  7e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2446  hypothetical protein  46.91 
 
 
398 aa  305  7e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.920431 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1714  protein of unknown function Met10  44.95 
 
 
404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3451  SAM-dependent methyltransferase  42.82 
 
 
396 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  43.04 
 
 
393 aa  302  6.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  41.22 
 
 
398 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  44.27 
 
 
388 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  40.98 
 
 
393 aa  299  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  40.86 
 
 
398 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  40.1 
 
 
397 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  41.98 
 
 
393 aa  297  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  42.78 
 
 
393 aa  297  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  40.7 
 
 
398 aa  296  5e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  40.46 
 
 
398 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3779  protein of unknown function Met10  42.93 
 
 
389 aa  295  9e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  39.9 
 
 
394 aa  295  9e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  40.62 
 
 
399 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  40.86 
 
 
398 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  40.36 
 
 
398 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0812  hypothetical protein  43.52 
 
 
398 aa  294  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.199944  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  42.01 
 
 
394 aa  293  4e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3722  SAM-dependent methyltransferase  42.67 
 
 
389 aa  292  8e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  42.49 
 
 
393 aa  292  8e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  40.25 
 
 
398 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  40.25 
 
 
398 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3862  protein of unknown function Met10  42.67 
 
 
389 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  40.84 
 
 
394 aa  291  2e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  40.41 
 
 
394 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  40.51 
 
 
399 aa  290  4e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  40 
 
 
398 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  40 
 
 
398 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  39.95 
 
 
416 aa  288  1e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  41.79 
 
 
396 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  41.56 
 
 
418 aa  288  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  42.56 
 
 
407 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3750  hypothetical protein  40.9 
 
 
398 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0864598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  42.3 
 
 
407 aa  286  5e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0366  SAM-dependent methyltransferase  44.5 
 
 
403 aa  286  5e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0859295  normal  0.454449 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  39.64 
 
 
396 aa  285  9e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  41.54 
 
 
396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  41.54 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  38.87 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  42.97 
 
 
426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  41.54 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  39.39 
 
 
396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  39.39 
 
 
396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  39.39 
 
 
396 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  39.39 
 
 
396 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  39.13 
 
 
396 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  39.8 
 
 
397 aa  280  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  38.42 
 
 
394 aa  279  6e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  40.92 
 
 
411 aa  278  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  42.67 
 
 
400 aa  278  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  42.53 
 
 
408 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  40.41 
 
 
397 aa  277  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  39.55 
 
 
397 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  39.64 
 
 
391 aa  277  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  38.82 
 
 
403 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  38.82 
 
 
403 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  38.82 
 
 
403 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  38.82 
 
 
403 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  40.1 
 
 
394 aa  277  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  40.77 
 
 
396 aa  277  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  38.82 
 
 
403 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  41.15 
 
 
400 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  39.03 
 
 
395 aa  275  8e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  40.89 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  40.4 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  40.51 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  40.89 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  40.51 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  40.51 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  40.51 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  37.82 
 
 
397 aa  274  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3058  PUA domain containing protein  42.97 
 
 
400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  37.34 
 
 
396 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  39.9 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>