More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0892 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  99.75 
 
 		 407 aa  827    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  830    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  48.32 
 
 		 398 aa  385  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  50.64 
 
 		 399 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3750  hypothetical protein  47.55 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0864598 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  49.87 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  49.87 
 
 		 398 aa  363  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  49.87 
 
 		 398 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  49.61 
 
 		 398 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  48.58 
 
 		 398 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  50.65 
 
 		 396 aa  356  5e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  48.58 
 
 		 398 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  48.58 
 
 		 398 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  48.58 
 
 		 398 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0366  SAM-dependent methyltransferase  50.26 
 
 		 403 aa  354  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0859295  normal  0.454449 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  48.07 
 
 		 399 aa  353  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  48.71 
 
 		 398 aa  352  5e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  48.06 
 
 		 398 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1714  protein of unknown function Met10  46.7 
 
 		 404 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0614  SAM-dependent methyltransferase  45.15 
 
 		 396 aa  342  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2446  hypothetical protein  48.57 
 
 		 398 aa  340  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.920431 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0812  hypothetical protein  46.8 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.199944  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3451  SAM-dependent methyltransferase  46.77 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2043  protein of unknown function Met10  50 
 
 		 402 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338836  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  43.85 
 
 		 426 aa  303  5.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  43.01 
 
 		 392 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  43.52 
 
 		 392 aa  282  9e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  42.86 
 
 		 396 aa  280  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  40.61 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  39.79 
 
 		 393 aa  279  8e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  40.1 
 
 		 393 aa  278  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  42.3 
 
 		 397 aa  276  6e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  39.85 
 
 		 393 aa  275  9e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  40.16 
 
 		 393 aa  274  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3333  SAM-dependent methyltransferase  42.01 
 
 		 416 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  40 
 
 		 391 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  38.5 
 
 		 394 aa  262  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  41.12 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  37.56 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1771  hypothetical protein  42.14 
 
 		 400 aa  256  5e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1954  SAM-dependent methyltransferase  40 
 
 		 398 aa  252  8.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  36.72 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  38.9 
 
 		 394 aa  241  1e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  37.28 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  37.57 
 
 		 394 aa  239  5e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3862  protein of unknown function Met10  40.58 
 
 		 389 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1304  SAM-dependent methyltransferase  40.77 
 
 		 396 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.730184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  33.07 
 
 		 415 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3779  protein of unknown function Met10  40.58 
 
 		 389 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  35.58 
 
 		 391 aa  231  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  35.32 
 
 		 391 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2647  SAM-dependent methyltransferase  40.51 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391524  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  36.29 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  38.15 
 
 		 400 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  36.87 
 
 		 413 aa  230  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0887  SAM-dependent methyltransferase  39.29 
 
 		 405 aa  229  8e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324188  normal  0.483591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  37.91 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  39.23 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  33.68 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3722  SAM-dependent methyltransferase  39.79 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  34.74 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1183  putative RNA methylase  39.23 
 
 		 427 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.414629  normal  0.94846 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2689  SAM-dependent methyltransferase  36.34 
 
 		 398 aa  226  7e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  34.7 
 
 		 416 aa  224  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  33.25 
 
 		 390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  33.68 
 
 		 418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  35.9 
 
 		 396 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  34.62 
 
 		 396 aa  219  8.999999999999998e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  35.9 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  36.32 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  35.9 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  36.71 
 
 		 396 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  34.75 
 
 		 398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  34.25 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  35.9 
 
 		 391 aa  216  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  35.9 
 
 		 396 aa  216  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  35.9 
 
 		 396 aa  216  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  33.97 
 
 		 422 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  35.37 
 
 		 396 aa  216  7e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  33.16 
 
 		 394 aa  215  9e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  34.9 
 
 		 404 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  33.73 
 
 		 425 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  34.9 
 
 		 404 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  34.9 
 
 		 404 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  38.48 
 
 		 388 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  33.65 
 
 		 423 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  34.9 
 
 		 404 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  36.9 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  35.15 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  32.11 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  36.9 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1086  methyltransferase small  33.24 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1446  hypothetical protein  41.49 
 
 		 390 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.721087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  35.59 
 
 		 400 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  34.43 
 
 		 418 aa  213  5.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  35.64 
 
 		 396 aa  213  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  35.64 
 
 		 396 aa  213  7e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  35.64 
 
 		 396 aa  213  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4030  protein of unknown function Met10  35.87 
 
 		 552 aa  212  9e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  36.75 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>