More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1086 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1086  methyltransferase small  100 
 
 
388 aa  771    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2204  PUA domain containing protein  42.38 
 
 
390 aa  310  2e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000936736  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  40.32 
 
 
392 aa  280  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  40.99 
 
 
395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  39.49 
 
 
394 aa  267  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  39.84 
 
 
415 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  37.67 
 
 
394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  40.21 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  37.4 
 
 
389 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  33.51 
 
 
391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  39.84 
 
 
391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  36.6 
 
 
418 aa  252  7e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  38.96 
 
 
391 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  38.96 
 
 
391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  36.51 
 
 
394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  34.76 
 
 
396 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  36.61 
 
 
393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  35.11 
 
 
394 aa  237  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  34.82 
 
 
394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  35.22 
 
 
390 aa  236  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  36.32 
 
 
394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  36.27 
 
 
409 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  35.73 
 
 
394 aa  233  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  35.57 
 
 
396 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  34.29 
 
 
396 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  35.64 
 
 
393 aa  229  6e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  34.76 
 
 
393 aa  228  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  34.04 
 
 
393 aa  228  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1889  hypothetical protein  37.01 
 
 
388 aa  228  2e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  35.31 
 
 
396 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  35.57 
 
 
396 aa  227  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  35.31 
 
 
396 aa  226  8e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  31.87 
 
 
392 aa  225  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  34.43 
 
 
393 aa  223  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  32.86 
 
 
439 aa  223  4.9999999999999996e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  34.03 
 
 
395 aa  222  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  33.6 
 
 
394 aa  222  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4090  PUA domain-containing protein  34.27 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.337957  normal  0.372554 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  33.33 
 
 
391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2702  putative SAM-dependent methyltransferase  32.98 
 
 
408 aa  220  3.9999999999999997e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1446  hypothetical protein  34.46 
 
 
390 aa  219  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.721087  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  32.22 
 
 
413 aa  219  7.999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  34.54 
 
 
396 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  34.19 
 
 
411 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0969  hypothetical protein  32.38 
 
 
395 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28559  normal  0.77249 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  34.45 
 
 
397 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0954  SAM-dependent methyltransferase  33.07 
 
 
384 aa  218  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  34.28 
 
 
396 aa  218  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  34.54 
 
 
396 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  33.93 
 
 
397 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  31.63 
 
 
388 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  34.54 
 
 
396 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  32.99 
 
 
404 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  34.54 
 
 
396 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  33.25 
 
 
404 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  34.54 
 
 
396 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3862  protein of unknown function Met10  31.54 
 
 
389 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  33.84 
 
 
397 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  33.93 
 
 
400 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  32.99 
 
 
404 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3779  protein of unknown function Met10  31.54 
 
 
389 aa  215  9e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  33.24 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  34.45 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  34.44 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  33.6 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  33.67 
 
 
400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  32.23 
 
 
404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3058  PUA domain containing protein  36.08 
 
 
400 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  32.23 
 
 
404 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  32.23 
 
 
404 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  32.23 
 
 
404 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  33.93 
 
 
397 aa  212  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3722  SAM-dependent methyltransferase  31.54 
 
 
389 aa  213  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  33.16 
 
 
397 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  30.13 
 
 
408 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  31.63 
 
 
396 aa  209  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0405  SAM-dependent methyltransferase  32.24 
 
 
385 aa  209  7e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  34.83 
 
 
418 aa  209  7e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  33.85 
 
 
397 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  32.39 
 
 
400 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0528  methyltransferase  32.49 
 
 
398 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000817153  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  30.99 
 
 
425 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  32.31 
 
 
396 aa  206  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  30.41 
 
 
400 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  31.79 
 
 
396 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  31.79 
 
 
396 aa  205  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  33.51 
 
 
400 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  35.06 
 
 
393 aa  205  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  30.98 
 
 
422 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  30.66 
 
 
423 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  30.13 
 
 
400 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  32.65 
 
 
396 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  32.04 
 
 
396 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  31.79 
 
 
396 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  31.79 
 
 
396 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  32.04 
 
 
391 aa  203  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  31.79 
 
 
396 aa  203  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  33.76 
 
 
397 aa  202  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  30.13 
 
 
400 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  31.47 
 
 
403 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.887543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>