More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3712 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
393 aa  808    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_002950  PG0364  hypothetical protein  47.89 
 
 
401 aa  349  5e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.953322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0528  methyltransferase  41.9 
 
 
398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000817153  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  41.54 
 
 
392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  42.03 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  40.61 
 
 
394 aa  282  6.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  40.85 
 
 
411 aa  279  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  41.85 
 
 
397 aa  279  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  40.1 
 
 
389 aa  273  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  40.9 
 
 
396 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  40.9 
 
 
396 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  40.9 
 
 
396 aa  266  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  40.9 
 
 
396 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  40.9 
 
 
396 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  40.15 
 
 
396 aa  266  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  41.4 
 
 
397 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  37.15 
 
 
396 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  40.1 
 
 
404 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  40.25 
 
 
396 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  40.59 
 
 
404 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  40.25 
 
 
396 aa  265  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  40.1 
 
 
404 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  38.3 
 
 
415 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  40.25 
 
 
396 aa  263  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  39.39 
 
 
397 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  40.1 
 
 
404 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  40.25 
 
 
396 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  40.1 
 
 
404 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  41.71 
 
 
397 aa  263  6e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  39.85 
 
 
404 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  39.85 
 
 
404 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  39.34 
 
 
394 aa  259  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  41.12 
 
 
396 aa  258  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  38.23 
 
 
397 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  40.1 
 
 
400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  37.65 
 
 
423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  36.5 
 
 
418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  37.5 
 
 
422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  39.39 
 
 
398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  37.24 
 
 
425 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  38.78 
 
 
396 aa  253  5.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  38.12 
 
 
395 aa  252  6e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  39.49 
 
 
397 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0139  PUA domain-containing protein  37 
 
 
397 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  38.42 
 
 
397 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  36.9 
 
 
394 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  38.23 
 
 
397 aa  249  8e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  37.66 
 
 
418 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  37.19 
 
 
396 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  39.25 
 
 
400 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  37.69 
 
 
396 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  37.19 
 
 
396 aa  247  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  37.19 
 
 
396 aa  247  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  38.42 
 
 
395 aa  246  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  36.87 
 
 
396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  36.87 
 
 
396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  37.19 
 
 
396 aa  246  6e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  37.19 
 
 
396 aa  246  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  36.62 
 
 
396 aa  246  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1062  SAM-dependent methyltransferase  36.02 
 
 
422 aa  245  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.647422 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  37.12 
 
 
391 aa  245  9e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3242  SAM-dependent methyltransferase  36.82 
 
 
397 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  37.19 
 
 
396 aa  244  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  36.55 
 
 
396 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  35.73 
 
 
391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  35.83 
 
 
425 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  35.83 
 
 
425 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  35.83 
 
 
425 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  39.8 
 
 
400 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  35.83 
 
 
425 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  35.83 
 
 
425 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  39 
 
 
400 aa  243  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  37.12 
 
 
396 aa  242  7e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  34.55 
 
 
416 aa  241  2e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  35.75 
 
 
403 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  35.75 
 
 
403 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  35.75 
 
 
403 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  35.75 
 
 
403 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  35.75 
 
 
403 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  35.32 
 
 
391 aa  237  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4090  PUA domain-containing protein  36.66 
 
 
396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.337957  normal  0.372554 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  36.09 
 
 
393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  36.36 
 
 
394 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2702  putative SAM-dependent methyltransferase  34.74 
 
 
408 aa  230  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  37.12 
 
 
408 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3058  PUA domain containing protein  37.75 
 
 
400 aa  230  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  33.76 
 
 
391 aa  229  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  36.2 
 
 
400 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  34.67 
 
 
393 aa  229  9e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  35.4 
 
 
409 aa  228  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  36.2 
 
 
400 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  36.2 
 
 
400 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2995  SAM-dependent methyltransferase  35.19 
 
 
395 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  35.22 
 
 
391 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  35.22 
 
 
391 aa  227  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  34.78 
 
 
393 aa  227  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3440  PUA  37.37 
 
 
393 aa  226  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3685  SAM-dependent methyltransferase  35.44 
 
 
395 aa  225  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  33.59 
 
 
392 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  33.08 
 
 
393 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>