More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0969 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0969  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  787    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28559  normal  0.77249 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1411  protein of unknown function Met10  43.56 
 
 		 388 aa  289  5.0000000000000004e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0405  SAM-dependent methyltransferase  41.49 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  37.14 
 
 		 392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  35.94 
 
 		 395 aa  236  4e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  36.58 
 
 		 391 aa  232  9e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  33.59 
 
 		 415 aa  232  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  35.55 
 
 		 391 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  32.13 
 
 		 389 aa  230  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1086  methyltransferase small  32.38 
 
 		 388 aa  230  4e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  34.1 
 
 		 418 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  34.1 
 
 		 391 aa  223  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  33.94 
 
 		 393 aa  224  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  35.79 
 
 		 397 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  33.68 
 
 		 393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  33.42 
 
 		 391 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  35.92 
 
 		 396 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  34.77 
 
 		 398 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  35.48 
 
 		 404 aa  216  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  35.48 
 
 		 404 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  32.9 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  31.81 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  35.48 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  35.48 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  35.48 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  33.16 
 
 		 393 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  34.6 
 
 		 397 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  34.99 
 
 		 404 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  35.31 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  32.9 
 
 		 393 aa  210  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  34.74 
 
 		 404 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2204  PUA domain containing protein  30.53 
 
 		 390 aa  209  6e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000936736  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  33.97 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  34.66 
 
 		 407 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  34.2 
 
 		 425 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  36.55 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  34.66 
 
 		 407 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  33.65 
 
 		 423 aa  207  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  34.02 
 
 		 396 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  33.67 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  33.42 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1889  hypothetical protein  30.75 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  32.9 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  35.1 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  33.96 
 
 		 425 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  33.96 
 
 		 425 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  33.96 
 
 		 425 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  33.42 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  33.96 
 
 		 425 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  33.96 
 
 		 425 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  35.35 
 
 		 397 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  35.59 
 
 		 400 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  35.84 
 
 		 408 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  33.76 
 
 		 396 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  34.84 
 
 		 400 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  35.09 
 
 		 400 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  33.76 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  34.02 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0139  PUA domain-containing protein  36.61 
 
 		 397 aa  200  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  30.85 
 
 		 390 aa  199  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  33.5 
 
 		 396 aa  199  9e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  34.94 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  34.84 
 
 		 400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  31.09 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  32.99 
 
 		 396 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  32.99 
 
 		 396 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  32.99 
 
 		 396 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  32.99 
 
 		 396 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  35.14 
 
 		 396 aa  196  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  32.99 
 
 		 396 aa  196  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  35.95 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  34.09 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  35.95 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  36.41 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  30.87 
 
 		 394 aa  192  9e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  31.77 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  30.47 
 
 		 394 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3862  protein of unknown function Met10  34.03 
 
 		 389 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3779  protein of unknown function Met10  34.03 
 
 		 389 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  35.97 
 
 		 396 aa  189  8e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3722  SAM-dependent methyltransferase  33.77 
 
 		 389 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  33.59 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  30.51 
 
 		 395 aa  186  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  31.46 
 
 		 397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  31.9 
 
 		 393 aa  182  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  31.98 
 
 		 400 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1446  hypothetical protein  33.08 
 
 		 390 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.721087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  33.67 
 
 		 396 aa  182  9.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3242  SAM-dependent methyltransferase  33.58 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3058  PUA domain containing protein  35.22 
 
 		 400 aa  179  8e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  28.64 
 
 		 390 aa  179  9e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  32.75 
 
 		 396 aa  178  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  29.85 
 
 		 396 aa  177  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  30.23 
 
 		 403 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  29.59 
 
 		 396 aa  176  7e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  29.59 
 
 		 396 aa  176  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  29.59 
 
 		 396 aa  176  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  30.75 
 
 		 396 aa  176  9e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2995  SAM-dependent methyltransferase  32.91 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>