More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0139 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0139  PUA domain-containing protein  100 
 
 		 397 aa  795    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3242  SAM-dependent methyltransferase  77.83 
 
 		 397 aa  630  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0805  SAM-dependent methyltransferase  73.8 
 
 		 395 aa  567  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969032 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2995  SAM-dependent methyltransferase  71.28 
 
 		 395 aa  565  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  68.51 
 
 		 394 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3685  SAM-dependent methyltransferase  71.03 
 
 		 395 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1062  SAM-dependent methyltransferase  64.92 
 
 		 422 aa  548  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3440  PUA  66.5 
 
 		 393 aa  527  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0903  SAM-dependent methyltransferase  68.87 
 
 		 406 aa  513  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  57 
 
 		 397 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  56.58 
 
 		 400 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  56 
 
 		 398 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  55.25 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  56.51 
 
 		 404 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  56.5 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  56.27 
 
 		 404 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  56.51 
 
 		 404 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  56.51 
 
 		 404 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  56.51 
 
 		 404 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  56.51 
 
 		 404 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  56.02 
 
 		 404 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  54.12 
 
 		 422 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  53.74 
 
 		 425 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  53.99 
 
 		 423 aa  411  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  56.44 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  54.84 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  53.27 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  53.27 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  53.27 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  55.83 
 
 		 400 aa  401  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  53.27 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  53.27 
 
 		 425 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  52.13 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  55.92 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  49.25 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  51.14 
 
 		 397 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  47.86 
 
 		 397 aa  359  5e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  49.49 
 
 		 396 aa  358  9e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  49.24 
 
 		 396 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  48.99 
 
 		 396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  48.99 
 
 		 396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  48.99 
 
 		 396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  46.33 
 
 		 396 aa  349  6e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  48.48 
 
 		 396 aa  348  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  48.23 
 
 		 396 aa  346  3e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  47.98 
 
 		 396 aa  345  8e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  47.07 
 
 		 396 aa  344  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  46.6 
 
 		 397 aa  344  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  48.23 
 
 		 396 aa  343  4e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  46.6 
 
 		 397 aa  342  5.999999999999999e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  47.19 
 
 		 397 aa  342  7e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  46.8 
 
 		 396 aa  342  8e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  46.8 
 
 		 391 aa  341  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  46.8 
 
 		 396 aa  342  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  46.8 
 
 		 396 aa  342  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  46.8 
 
 		 396 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  46.8 
 
 		 396 aa  340  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  46.85 
 
 		 418 aa  340  4e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  47.47 
 
 		 396 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  46.68 
 
 		 396 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  44.44 
 
 		 396 aa  335  5.999999999999999e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  45.78 
 
 		 403 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  45.78 
 
 		 403 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  45.78 
 
 		 403 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  45.78 
 
 		 403 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  45.78 
 
 		 403 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  46.23 
 
 		 396 aa  328  7e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  44.7 
 
 		 395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  44.97 
 
 		 396 aa  326  5e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  44.97 
 
 		 396 aa  326  5e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  44.97 
 
 		 396 aa  325  7e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3058  PUA domain containing protein  47.44 
 
 		 400 aa  318  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  40.81 
 
 		 394 aa  316  4e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  46.45 
 
 		 367 aa  315  9e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  46.45 
 
 		 367 aa  315  9e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  42.86 
 
 		 394 aa  303  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  43.47 
 
 		 396 aa  302  9e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4090  PUA domain-containing protein  43.47 
 
 		 396 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.337957  normal  0.372554 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  39.53 
 
 		 395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  42.12 
 
 		 392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  37 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  35.44 
 
 		 389 aa  250  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  36.87 
 
 		 418 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  36.2 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2323  methyltransferase small  42.79 
 
 		 400 aa  245  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.475171  hitchhiker  0.00560103 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  41.01 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  41.01 
 
 		 400 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  40.45 
 
 		 408 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  41.01 
 
 		 400 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  35.38 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  34.6 
 
 		 415 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  36.68 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  35.53 
 
 		 391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  35.2 
 
 		 394 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  38.13 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  35.7 
 
 		 393 aa  230  3e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0364  hypothetical protein  37.44 
 
 		 401 aa  229  9e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.953322 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  37.94 
 
 		 409 aa  226  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  36.27 
 
 		 393 aa  224  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  34.18 
 
 		 393 aa  224  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>