More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0604 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  100 
 
 
394 aa  815    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  87.31 
 
 
394 aa  726    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  53.45 
 
 
415 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  52.31 
 
 
391 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  51.54 
 
 
391 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  53.45 
 
 
389 aa  413  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  52.05 
 
 
395 aa  410  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  51.79 
 
 
390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  51.76 
 
 
413 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  48.85 
 
 
418 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  47.59 
 
 
400 aa  361  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  45.78 
 
 
392 aa  344  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  42.2 
 
 
391 aa  328  7e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  43.8 
 
 
391 aa  326  5e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  45.02 
 
 
409 aa  323  5e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  43.73 
 
 
394 aa  318  7.999999999999999e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  43.04 
 
 
391 aa  317  3e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  43.72 
 
 
397 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  39.53 
 
 
396 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  42.22 
 
 
416 aa  306  3e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  41.58 
 
 
404 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  40.7 
 
 
439 aa  306  5.0000000000000004e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  41.34 
 
 
404 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  41.34 
 
 
404 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  41.34 
 
 
404 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  41.09 
 
 
404 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  41.34 
 
 
404 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  41.09 
 
 
404 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  40.2 
 
 
393 aa  300  3e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  43 
 
 
400 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  39.95 
 
 
423 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  40.05 
 
 
422 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  39.76 
 
 
425 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1889  hypothetical protein  39.07 
 
 
388 aa  295  7e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  41.79 
 
 
396 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  41.3 
 
 
394 aa  293  4e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  37.69 
 
 
392 aa  292  6e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  40.83 
 
 
396 aa  291  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  42.5 
 
 
400 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  41.54 
 
 
396 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  40 
 
 
393 aa  290  3e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  42.35 
 
 
389 aa  290  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  40.91 
 
 
393 aa  288  9e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  39.29 
 
 
425 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  39.29 
 
 
425 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  39.29 
 
 
425 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  39.29 
 
 
425 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  39.29 
 
 
425 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  41 
 
 
400 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  38.42 
 
 
394 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  41.28 
 
 
396 aa  288  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  41.28 
 
 
396 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  40.71 
 
 
397 aa  286  5e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  40.2 
 
 
393 aa  285  9e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  40.81 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  39.12 
 
 
391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  39.19 
 
 
393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  40.81 
 
 
397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  41.15 
 
 
396 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  39.69 
 
 
388 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  41.41 
 
 
396 aa  281  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  40.5 
 
 
400 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  41.15 
 
 
396 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  41.15 
 
 
396 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  41.15 
 
 
396 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  40.15 
 
 
411 aa  279  6e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  38.58 
 
 
394 aa  278  1e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  39.95 
 
 
395 aa  276  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  39.64 
 
 
397 aa  276  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  37.56 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  37.56 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  37.82 
 
 
396 aa  273  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  37.56 
 
 
396 aa  273  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  38.64 
 
 
397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  40.26 
 
 
396 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  40.1 
 
 
396 aa  272  7e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  37.56 
 
 
396 aa  272  8.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  41.28 
 
 
397 aa  272  8.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  41.24 
 
 
418 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  39.39 
 
 
396 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  37.82 
 
 
396 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  37.4 
 
 
391 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  38.83 
 
 
394 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  37.31 
 
 
396 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  37.31 
 
 
396 aa  271  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3862  protein of unknown function Met10  38.22 
 
 
389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3779  protein of unknown function Met10  38.22 
 
 
389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  40.51 
 
 
397 aa  269  5.9999999999999995e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  38.14 
 
 
394 aa  269  8e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3722  SAM-dependent methyltransferase  37.96 
 
 
389 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  39.39 
 
 
398 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  37.56 
 
 
403 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  37.56 
 
 
403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  37.56 
 
 
403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  37.56 
 
 
403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  37.56 
 
 
403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  36.53 
 
 
396 aa  265  8.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  37.82 
 
 
398 aa  265  8.999999999999999e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  36.53 
 
 
396 aa  265  8.999999999999999e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  36.53 
 
 
396 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>