More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3058 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3058  PUA domain containing protein  100 
 
 		 400 aa  810    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  56.81 
 
 		 396 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  56.28 
 
 		 396 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  56.54 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  56.28 
 
 		 396 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  56.52 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  56.28 
 
 		 396 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  56.28 
 
 		 396 aa  432  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  56.28 
 
 		 396 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  56.54 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  56.54 
 
 		 396 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  54.82 
 
 		 411 aa  425  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  54.36 
 
 		 395 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  53.02 
 
 		 418 aa  423  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  54.83 
 
 		 397 aa  421  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  53.08 
 
 		 397 aa  420  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  55.75 
 
 		 397 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  53.5 
 
 		 396 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  50.76 
 
 		 396 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  50.76 
 
 		 396 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  51.65 
 
 		 396 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  51.02 
 
 		 403 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  51.92 
 
 		 396 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  50.76 
 
 		 396 aa  412  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  51.13 
 
 		 397 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  51.02 
 
 		 403 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  51.02 
 
 		 403 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  50.76 
 
 		 396 aa  412  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  51.01 
 
 		 396 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  51.65 
 
 		 396 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  51.64 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  51.02 
 
 		 403 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  51.77 
 
 		 396 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  51.02 
 
 		 403 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  50.51 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  50.51 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  50.64 
 
 		 391 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  53.69 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  53.73 
 
 		 397 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  50.76 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  52.53 
 
 		 400 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  51.02 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  50.13 
 
 		 397 aa  378  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  54.45 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  51.28 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  51.28 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  51.28 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  51.28 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  51.28 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  51.28 
 
 		 404 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  50.64 
 
 		 398 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  51.03 
 
 		 404 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  51.3 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  51.04 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  48.66 
 
 		 425 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  48.41 
 
 		 423 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  48.77 
 
 		 422 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  49.05 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  49.05 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  49.48 
 
 		 400 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  50 
 
 		 394 aa  364  2e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  48.18 
 
 		 425 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  48.18 
 
 		 425 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  48.18 
 
 		 425 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  48.18 
 
 		 425 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  48.18 
 
 		 425 aa  362  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  51.04 
 
 		 394 aa  356  3.9999999999999996e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1062  SAM-dependent methyltransferase  49.03 
 
 		 422 aa  345  7e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3685  SAM-dependent methyltransferase  50.91 
 
 		 395 aa  342  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0805  SAM-dependent methyltransferase  49.61 
 
 		 395 aa  339  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969032 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2995  SAM-dependent methyltransferase  50.65 
 
 		 395 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0139  PUA domain-containing protein  47.44 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  43.01 
 
 		 394 aa  336  5e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  47.14 
 
 		 396 aa  335  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3242  SAM-dependent methyltransferase  47.96 
 
 		 397 aa  335  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3440  PUA  48.7 
 
 		 393 aa  325  7e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4090  PUA domain-containing protein  48.07 
 
 		 396 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.337957  normal  0.372554 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2323  methyltransferase small  50.39 
 
 		 400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.475171  hitchhiker  0.00560103 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  39.89 
 
 		 415 aa  302  8.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  40.47 
 
 		 395 aa  295  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0903  SAM-dependent methyltransferase  46.63 
 
 		 406 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  41.07 
 
 		 391 aa  289  6e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  42.3 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  37.73 
 
 		 418 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  39.74 
 
 		 391 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  41.56 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  43.75 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  38.96 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  41.11 
 
 		 394 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  39.95 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  38.32 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  41.24 
 
 		 413 aa  272  8.000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  39.57 
 
 		 391 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  37.86 
 
 		 392 aa  263  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  36.01 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  38.54 
 
 		 409 aa  262  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  40.53 
 
 		 393 aa  260  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  36.01 
 
 		 391 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  37.73 
 
 		 393 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  39.95 
 
 		 394 aa  257  3e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>